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使用Gaussian+PySOC在TDDFT下计算旋轨耦合矩阵元

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发布时间: 2018-3-15 05:11

正文摘要:

2018-Dec-29注:有不少人表示PySOC运行不了。只要读者使用本文的操作系统、严格按本文的操作步骤计算,至少本文的例子是绝对能运行成功的。读者应当先确保本文例子能运行正常,由此确认安装方式和自己的操作过程无误 ...

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sobereva 发表于 Post on 2021-10-16 03:14:29
shuifangren 发表于 2021-10-15 16:45
sob老师,您好,您在本贴中提到“至于具体如何通过本文计算的旋轨耦合矩阵元计算磷光速率,笔者之后会另文 ...

用Dalton算。靠SOC矩阵元结合微扰公式,根据我的经验,明显不如Dalton基于响应函数算得准
shuifangren 发表于 Post on 2021-10-15 16:45:28
sob老师,您好,您在本贴中提到“至于具体如何通过本文计算的旋轨耦合矩阵元计算磷光速率,笔者之后会另文介绍。” 我想用PySOC得到的SOC结果去计算磷光速率,但是没有找到您其他博文关于这部分内容的,所以想求助一下~
Believe 发表于 Post on 2020-7-21 08:46:59
好的,谢谢sob老师~
sobereva 发表于 Post on 2020-7-21 00:33:23
Believe 发表于 2020-7-20 22:18
sob老师,您好!我想知道怎样通过Gaussian+PySOC计算的旋轨耦合矩阵元计算磷光速率?“通过本文计算的旋轨 ...

需要自己写程序实现,公式可参考Chem. Rev. 2017, 117, 6500
我也写过这么个程序,但发现结果不如Dalton通过响应理论算的稳健,也就没有再写博文介绍
Believe 发表于 Post on 2020-7-20 22:18:43
sob老师,您好!我想知道怎样通过Gaussian+PySOC计算的旋轨耦合矩阵元计算磷光速率?“通过本文计算的旋轨耦合矩阵元计算磷光速率,笔者之后会另文介绍。”谢谢您~
sobereva 发表于 Post on 2020-6-9 16:03:12
13104468322 发表于 2020-6-9 15:46
Error when reading gaussian output
Traceback (most recent call last):
  File "/home/user039/soft/e ...

要么操作不对,要么python版本不兼容
建议用ORCA
13104468322 发表于 Post on 2020-6-9 15:46:34
Error when reading gaussian output
Traceback (most recent call last):
  File "/home/user039/soft/export/pysoc/pysoc/bin/soc.py", line 491, in <module>
    write_file(mo_ene, 'mo_ene.dat', '{}  ')
NameError: name 'mo_ene' is not defined
forrtl: No such file or directory
forrtl: severe (29): file not found, unit 171, file /home/user039/guo-ceshi/lingf/hbps/pysoc/wang/s1/soc_td_input.dat
Image              PC                Routine            Line        Source            
soc_td             0000000000426956  Unknown               Unknown  Unknown
soc_td             000000000043288B  Unknown               Unknown  Unknown
soc_td             0000000000407B24  init_prep_mp_read          26  init_prep.f90
soc_td             0000000000402D23  MAIN__                     14  soc_td.f90
soc_td             0000000000402CCE  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00000037B7A1ED5D  Unknown               Unknown  Unknown
soc_td             0000000000402BD9  Unknown               Unknown  Unknown

sobereva老师,出现这种报错是怎么回事@sobereva
sobereva 发表于 Post on 2020-1-3 18:39:54
q1w2e3 发表于 2020-1-3 18:33
sob老师好,我用ubuntu虚拟器安装了python2.7.17和pysoc,按照您的教程修改后,运行pysoc.py命令时出现报错 ...

我只对CentOS用户提供帮助
q1w2e3 发表于 Post on 2020-1-3 18:33:46
sob老师好,我用ubuntu虚拟器安装了python2.7.17和pysoc,按照您的教程修改后,运行pysoc.py命令时出现报错:

/bin/sh: 1: /sob/pysoc/bin/soc.py: not found
/bin/sh: 1: /sob/pysoc/bin/soc_td: not found

请问是什么原因呢?谢谢!
sobereva 发表于 Post on 2019-11-30 03:08:08
陈丢丢 发表于 2019-11-29 16:42
谢谢老师。那我想算DFT下的SOC,可以用什么软件呢?

用NWChem做SODFT在DFT计算中考虑旋轨耦合效应
http://sobereva.com/368http://bbs.keinsci.com/thread-5573-1-1.html

要么Dirac等支持二分量或四分量相对论计算的程序,旋轨耦合效应自然就体现进去了
陈丢丢 发表于 Post on 2019-11-29 16:42:50

谢谢老师。那我想算DFT下的SOC,可以用什么软件呢?
sobereva 发表于 Post on 2019-11-29 08:25:09
陈丢丢 发表于 2019-11-28 18:22
sob老师好,我想请问下pysoc或者ORCA软件可以在DFT下计算旋轨耦合矩阵元?单线态和三线态的。如果可以是直 ...

不能
陈丢丢 发表于 Post on 2019-11-28 18:22:10
sob老师好,我想请问下pysoc或者ORCA软件可以在DFT下计算旋轨耦合矩阵元?单线态和三线态的。如果可以是直接把输入文件的关键词换成DFT的吗?
sobereva 发表于 Post on 2019-11-1 07:30:47
hanmingxi 发表于 2019-10-31 11:49
嗯嗯,还想问您下这两个使用哪个得到的激发能比较好,是SOC的还是S1单重态的?

你还没有理请逻辑关系
每个结构下都能算激发能,没有好不好,只能说哪个对当前研究更有意义。诸如你要研究荧光发射能,显然得用S1极小点结构下的
看此文补补基本知识
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314http://bbs.keinsci.com/thread-2413-1-1.html
sobereva 发表于 Post on 2019-11-1 07:29:22
hanmingxi 发表于 2019-10-31 16:24
老师,请问我在用Gaussian+PySOC计算时出现下面的报错,之后我又运行了下例子是正常的,这个要怎么修改?下 ...

pysoc这玩意我已经弃了,赶紧改用ORCA,更快更方便,还可以做到更准确

使用ORCA在TDDFT下计算旋轨耦合矩阵元和绘制旋轨耦合校正的UV-Vis光谱
http://sobereva.com/462http://bbs.keinsci.com/thread-12114-1-1.html

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