“第10届量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班将于5月4-8日于北京举办,这是一次性完整、系统学习波函数分析的各种理论知识和全面掌握强大的Multiwfn波函数分析程序使用的最不可错过的机会!请点击此链接查看详情和报名方式,欢迎参加!

“第18届北京科音分子动力学与GROMACS培训班” 将于5月23-26日于北京举办。这是一次性全面、系统学习分子动力学模拟知识和最流行的分子动力学程序GROMACS的关键机会!报名正在进行中,请点击此链接查看详情,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

用gmx msd 输出均方根位移出现了错误

查看数: 13758 | 评论数: 1 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2018-3-15 19:35

正文摘要:

当我用gromacs模拟离子液体(采用的是OPLSAA力场)的扩散系数时出现了图中扩散系数并没有随温度增加而迅速增加的问题, 二是可能是什么原因导致的这种结果,nvt.mdp文件在附件中,谢谢。

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2018-3-16 01:58:16
gmx的msd曲线没有任何问题
计算msd之前先确认体系已经跑平衡了(统计性质要对产生相做)

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-4-16 20:42 , Processed in 0.311491 second(s), 31 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list