LWM 发表于 2023-7-12 15:42
楼主你好，我最近也在做CO2-H2O两相体系的模拟，想问下你有没有遇到CO2抱团的情况

楼主，你好，我最近也是在做类似的包括气体的三相模拟。有几个问题想咨询一下你：
1. 请问气体分子参数选择的是那个？ 是TraPPE力场中的参数吗？看到论坛sob老师说这个是最合适的
2.模型构建中水分子参数用的是那个力场中的呀，方便提供一下你的top文件学习一下吗？

汀紫墨 发表于 2018-4-4 16:27
自顶下，描述的再清楚点，继续咨询大神们。关于gromacs中不同分子之间作用力参数，如 ...

楼主你好，我最近也在做CO2-H2O两相体系的模拟，想问下你有没有遇到CO2抱团的情况

自己在力场拓扑文件里添加对应的[ nonbond_params ] 项就可以实现

自顶下，描述的再清楚点，继续咨询大神们。关于gromacs中不同分子之间作用力参数，如二氧化碳和水的体系，本人理解的是（可能理解错了）：TOP文件中仅是单独书写二氧化碳和水的原子键角等参数，那么二氧化碳和水之间的作用力由什么参数体现？由不同组合规则（如Lorentz-Berthelot）表现的么？那组合规则是在选用力场时就已经确定下来了。那如我上面截图文献中，添加修正因子X来修改二氧化碳-水氧原子间ξ，这一操作怎么实现？