vayne 发表于 2020-6-11 19:10 您好我在计算热导率中也遇到了和您一样的问题，想问一下NVE体系温度一直上升的问题您最后是如何解决的 |
vayne 发表于 2020-6-11 09:09 您好，我在计算热导率的时候，NPT之后进行NVE也出现了温度逐渐升高，导致最后计算热导率的时候报错，这个问题您有解决吗？ |
张张包 发表于 2022-5-6 22:39 请问您解决了吗？ |
| 得到哈密顿量和电子结构相关的信息用NVT之后的NVE统计更准确。 |
张张包 发表于 2022-5-7 14:36 能 |
sobereva 发表于 2022-5-7 09:54 谢谢老师回复。另外想请教：对这个体系直接NPT发现密度上升，若通过退火加速体系平衡，优先选择NPT系综而非NVT，能否理解成NVT下体积不变，密度增加，体系会出现空洞或孔隙，结构并不趋于合理，对体系的弛豫并无促进作用？ |
张张包 发表于 2022-5-6 22:39 这种体系找能量最低构象没有意义 有意义的是通过退火让体系相较于常规MD显著更快地达到平衡状态，从而之后能做平衡相计算收集数据 |
sobereva 发表于 2018-7-28 10:05 老师您好，请问对于密度未知的聚合物体系，是否先通过退火（NPT）找到能量最低的构象，再充分进行NPT的平衡相计算呢？ |
vayne 发表于 2020-6-11 09:09 我现在基本不用NVE，sob老师已经说得很清楚。往上看 |
k64_cc 发表于 2020-6-11 11:32 您好，谢谢您的回复，我才发现楼主用的是MS软件。我是采用lammps软件通过MP法计算石墨烯热导率，所以不是很懂您提到的“双精度、deltaT”。 |
vayne 发表于 2020-6-11 09:09 切成双精度，减小deltaT，然后多做几组平行实验…… |
xylz6188 发表于 2018-7-28 08:20 你好，请问NVE体系温度一直上升的问题你最后是如何解决的？我也遇见这个情况，但我跑NVE前用的是NVT控温。 |
sobereva 发表于 2018-7-28 10:05 谢谢sob。学习了 |
xylz6188 发表于 2018-7-28 08:20 非键作用误差，动力学积分精度，都会造成NVE过程能量不守恒 没有必要非得用NVE，用NVE反倒因为能量守恒性难以维持而容易带来麻烦。一般情况直接上NPT便可，若有特殊目的，等盒子尺寸稳定了可再切换到NVT。至于担心控温导致影响动力学行为而使得扩散问题研究不合理，那是对于诸如anderson之类热浴而言的，常用的berendsen、V-rescale都不用担心这个。 |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2025-8-14 00:16 , Processed in 0.225535 second(s), 25 queries , Gzip On.
组图打开中，请稍候......
收藏 Add to favorites