本帖最后由 snljty2 于 2022-5-24 21:18 编辑 王若曦 发表于 2022-5-24 16:38 你再认真看一遍,说的是解析梯度都没有。Hessian需要二阶导数,半数值的也需要一阶解析导数。趁早放弃。要么换泛函,要么换软件。另外这个问题和本贴没什么直接关系。 |
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阅读各位老师的帖子,我将关键词改成了numfreq,可是用m062x进行激发态结构优化和频率分析时系统还是报错,请教一下这是什么原因啊?虽然out文件中说GGA类型的泛函没法做解析频率的计算,但是我已经改成了数值频率了。(ps:已附上我的inp和out文件截图) |
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本帖最后由 长颈鹿先森 于 2018-5-3 18:53 编辑 sobereva 发表于 2018-5-3 00:42 我仔细看了下热力学量的计算公式之后,得出的结论 Thermal correction to Enthalpy(gaussian)=ZPE+Total correction+Thermal Enthalpy correction (ORCA) 根据G=H-T*S;G=E+ZPE+△H-T*S: Thermal correction to Gibbs Free Energy(gaussian)=For completeness - the Gibbs free enthalpy minus the electronic energy(orca) |
长颈鹿先森 发表于 2018-5-2 20:07 升温对焓增加的频率校正因子,以及熵的校正因子,通常都比较接近于1,因此算这部分的时候可以无视频率校正因子,但是ZPE校正因子最好考虑。 根据具体输出,搞清楚热力学量的计算公式,手动处理就完了 如果搞不清楚输出,就在Gaussian和ORCA下都用HF/STO-3G对相同结构做振动分析,对比结果马上就明白了 |
长颈鹿先森 发表于 2018-5-2 20:35 不对 频率校正因子是乘到频率上,然后用校正过的频率代入到热力学量计算公式里 仅对于ZPE,将频率校正因子直接乘到ZPE上,和先把校正因子乘到频率上再计算ZPE是一码事 公式在此程序文档里都有 Shermo:计算气相分子配分函数和热力学数据的简单程序 http://sobereva.com/315 |
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感谢sob老师的耐心回复,我还是不太懂在orca中计算反应能量的问题。 想计算得到均裂反应后的势垒,A--->B+C,在orca中应该用哪个能量呢? gaussian中是计算反应前后(考虑ZPE、焓和熵校正因子后)的吉布斯自由能变化;但是orca中应该怎么考虑校正呢,几何优化之后输出文件中ZPE的值乘上ZPE校正因子然后加上高水平计算的单点能的输出文件中的FINAL SINGLE POINT ENERGY这是考虑零点能校正后的电子能量是吗? 想在orca中得到校正后的反应焓值用于计算BDE;校正后的吉布斯自由能算反应势垒,不知道该用哪个能量,怎么校正? |
长颈鹿先森 发表于 2018-5-1 16:53 可以 |
sobereva 发表于 2018-5-1 13:23 谢谢老师, 在这个双杂化泛函级别下计算出来的能量精度也好可以被接受吧 |
长颈鹿先森 发表于 2018-5-1 11:08 双杂化那样用可以 CCSD(T)/cc-pVDZ-F12,即便10个原子,只有四核时耗时也是很高的,实际测试一下便知 |
长颈鹿先森 发表于 2018-5-1 10:58 直接写D3,默认就是BJ阻尼 |
sobereva 发表于 2018-4-30 22:28 此外,还有个问题,在orca中计算5~12原子的自由基和分子间的反应势垒、焓值等问题的时候,选择您推荐的RI-PWPB95 D3算单点,B3LYP/G 6-311G** D3BJ 优化,这个级别精度可以吧。我试了好几种方法算单点能,CCSD(T)-F12/RI 和DLPNO-CCSD(T)/cc-pVTZ计算11原子的分子的单点能耗时太长了,可能是我电脑不行4核的,所以想着用您推荐的30~40原子的方法RI-PWPB95 D3来计算单点能,所以想问您这个级别计算10个原子甚至<10个原子的可不可以 |
sobereva 发表于 2018-4-30 22:28 谢谢老师耐心的解释,刚开始学习orca,在orca中输入形式是:! B3LYP/G 6-311G** D3BJ Opt Freq tightSCF pal4 就行是吗 |
长颈鹿先森 发表于 2018-4-30 21:11 有好处,建议加 |
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