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做IRC增大maxpoints对结果没有影响

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发布时间: 2018-5-9 15:27

正文摘要:

老师,我对找到的过渡态进行IRC分析,第一次的命令为#p irc=calcall int=ultrafine b3lyp/6-311g(d) geom=connectivity,结果为图1;第二次的命令为#p irc=(calcall,stepsize=5,maxpoints=100) int=ultrafine b3lyp/ ...

回复 Reply

zc000 发表于 Post on 2018-5-13 21:25:14
mutron 发表于 2018-5-13 17:07
留意到把坐标提取出来单独做freq居然是基态。无论怎么变动设置:opt=vtight、int=superfine、提取内坐标、g ...

谢谢您
sobereva 发表于 Post on 2018-5-13 20:01:37
mutron 发表于 2018-5-13 17:11
奇怪了,怎么最近传的gif都被重新编辑过导致动不了

因为直接上传的图会自动被加水印
压缩成压缩包后上传即可解决,但gif略大的时候还是建议用网盘以节约论坛空间
Jasminer 发表于 Post on 2018-5-13 17:25:26
mutron 发表于 2018-5-13 17:07
留意到把坐标提取出来单独做freq居然是基态。无论怎么变动设置:opt=vtight、int=superfine、提取内坐标、g ...

看来涉及到O的时候一定要注意有没有势能面交叉
mutron 发表于 Post on 2018-5-13 17:11:53
奇怪了,怎么最近传的gif都被重新编辑过导致动不了
mutron 发表于 Post on 2018-5-13 17:07:29
本帖最后由 mutron 于 2018-5-13 20:16 编辑

留意到把坐标提取出来单独做freq居然是基态。无论怎么变动设置:opt=vtight、int=superfine、提取内坐标、geom=allcheck,ts优化结果有一个虚频,但是单独做freq还是基态


而且留意到freq(ultrafinegrid)的E(UB3LYP)=-2386.18773517,ts结果的E(UB3LYP)=-2386.15877802,很有可能freq(包括IRC)任务计算收敛到能量更低的态上面,导致题主IRC做的其实是基态


用multiwfn查看自旋密度:
     ts计算结果E(UB3LYP)=-2386.15877802
     提取坐标后的计算结果E(UB3LYP)=-2386.18773517,基本对应1楼IRC最高点的能量



解决办法就是加上guess=tcheck,结果就正常了:
     



zc000 发表于 Post on 2018-5-10 08:00:02
liyuanhe211 发表于 2018-5-9 22:03
百度盘传一下opt和几个IRC的输入输出文件吧

链接:https://pan.baidu.com/s/1RtIr74YBcjxkCDQOQIuikQ 密码:saom
liyuanhe211 发表于 Post on 2018-5-9 22:03:01
zc000 发表于 2018-5-9 17:24
李老师,我做过渡态的命令是#p opt=(calcall,tight,ts) int=ultrafine freq b3lyp/6-311g(d) geom=connec ...

百度盘传一下opt和几个IRC的输入输出文件吧
zc000 发表于 Post on 2018-5-9 21:42:37
我本是个娃娃 发表于 2018-5-9 20:25
很有可能你的IRC曲线两侧走的是同一个路径,也就是说,不是对应的TS的两端,只是其中一端而已

老师,像我这种情况应该怎么处理?
我本是个娃娃 发表于 Post on 2018-5-9 20:25:37
很有可能你的IRC曲线两侧走的是同一个路径,也就是说,不是对应的TS的两端,只是其中一端而已
zc000 发表于 Post on 2018-5-9 17:24:30
liyuanhe211 发表于 2018-5-9 16:52
“不精确”不是“不对”,和试了多少种没关系。比如优化时加opt=tight(DFT可能需要int=ultrafine)

李老师,我做过渡态的命令是#p opt=(calcall,tight,ts) int=ultrafine freq b3lyp/6-311g(d) geom=connectivity
sobereva 发表于 Post on 2018-5-9 17:19:05
你的IRC明显是错的,正常的IRC不可能有个尖峰
仔细阅读此文,确定该注意的都注意了。maxpoints文中有详细说明
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400
liyuanhe211 发表于 Post on 2018-5-9 16:52:39
zc000 发表于 2018-5-9 16:48
我的这个体系比较简单,就三个原子,过渡态我试了很多种,然后对每种过渡态都进行了分析,发现出来的结果 ...

“不精确”不是“不对”,和试了多少种没关系。比如优化时加opt=tight(DFT可能需要int=ultrafine)
zc000 发表于 Post on 2018-5-9 16:48:52
liyuanhe211 发表于 2018-5-9 15:46
考虑过渡态不精确地可能

我的这个体系比较简单,就三个原子,过渡态我试了很多种,然后对每种过渡态都进行了分析,发现出来的结果左右两边的结构基本一样。我就想是不是我的这个反应不成立?
liyuanhe211 发表于 Post on 2018-5-9 15:46:20
考虑过渡态不精确地可能

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