namd建模时一个水盒子和一个分子示意图怎么画，谢谢

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发布时间: 2018-5-14 11:25

本帖最后由 xiaochenxi 于 2018-5-14 11:26 编辑 namd建模时一个水盒子和一个分子示意图怎么画，谢谢。实在是不知道怎么画的，谢谢大家的帮忙

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sobereva 发表于 Post on 2018-5-15 19:01:06

xiaochenxi 发表于 2018-5-15 11:22
你好：
我试了一下，我的是卟啉和水分子组成的pdb文件，在Graphics Representations中我只想让卟啉分 ...

打开pdb文件，看两种分子残基名都叫什么
诸如卟啉的残基名是POR，你就输入resname POR就能选中

xiaochenxi 发表于 Post on 2018-5-15 11:22:13

sobereva 发表于 2018-5-14 19:08

你好：
我试了一下，我的是卟啉和水分子组成的pdb文件，在Graphics Representations中我只想让卟啉分子变成CPK形式，水分子不变，我在Selected Atoms中输入什么关键词才能实施这一步，因为我把selections中的singlewords词都试了不行，谢谢

sobereva 发表于 Post on 2018-5-14 19:08:17

xiaochenxi 发表于 Post on 2018-5-14 18:18:44

fhh2626 发表于 2018-5-14 17:53
没明白，就点几下鼠标就行了还要怎么简单。。。

主要是不会，看了上面的没有学会

fhh2626 发表于 Post on 2018-5-14 17:53:46

xiaochenxi 发表于 2018-5-14 17:18
你好，除了提到的方法还有其他简单的方法吗？谢谢

没明白，就点几下鼠标就行了还要怎么简单。。。

xiaochenxi 发表于 Post on 2018-5-14 17:18:42

fhh2626 发表于 2018-5-14 12:00
See http://bionano.physics.illinois. ... tachyonTutorial.pdf

你好，除了提到的方法还有其他简单的方法吗？谢谢

fhh2626 发表于 Post on 2018-5-14 12:00:01

本帖最后由 fhh2626 于 2018-5-14 12:01 编辑

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