gromacs在能量最小化出现LINCS警告

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发布时间: 2018-5-15 14:23

本帖最后由青青青于 2019-6-21 11:35 编辑【求删除】gromacs能量最小化出现l了好多的LINCS警告，用的martini力场，constrain已经设置为none了，还是同样的问题。谢谢您的解答。

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maozh 发表于 Post on 2020-9-2 10:16:53

请问楼主这个问题怎么解决的呢？

青青青 发表于 Post on 2018-5-16 19:22:24

sobereva 发表于 2018-5-16 18:26
用的是martini，这种重要信息在求助一开始就应当说明

请问老师是力场的问题吗？可是力场文件在别的体系里面模拟是没有错误的呀

青青青 发表于 Post on 2018-5-16 19:19:46

sobereva 发表于 2018-5-16 18:26
用的是martini，这种重要信息在求助一开始就应当说明

不好意思，我重新编辑一下

sobereva 发表于 Post on 2018-5-16 18:26:51

用的是martini，这种重要信息在求助一开始就应当说明

青青青 发表于 Post on 2018-5-16 18:17:06

sobereva 发表于 2018-5-15 19:58
重新编辑帖子。图没发上来。注意仔细阅读置顶的新人必读贴

新人必读帖刚刚读过啦，颇有启发。

青青青 发表于 Post on 2018-5-16 18:16:19

sobereva 发表于 2018-5-16 18:03
设置none不可能有这种提示

真的，intergrator设置的steep,把em.mdp给您看一下，谢谢您的回答。

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sobereva 发表于 Post on 2018-5-16 18:03:32

设置none不可能有这种提示

青青青 发表于 Post on 2018-5-16 16:56:21

beyond 发表于 2018-5-16 01:03
优化的时候，可以先试一下关闭 constraints

constrain 已经设置none了。。

beyond 发表于 Post on 2018-5-16 01:03:10

优化的时候，可以先试一下关闭 constraints

sobereva 发表于 Post on 2018-5-15 19:58:36

重新编辑帖子。图没发上来。注意仔细阅读置顶的新人必读贴

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