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本帖最后由 iuseroot 于 2026-3-11 09:19 编辑
更新:
2026/03/11:
更新GROMACS版本至2026.1。GROMACS 2026系列已官方支持 AMBER ff14SB 和 ff19SB 力场。
升级依赖项:OpenBLAS升级为0.3.31,hwloc升级为2.13.0。
升级显卡驱动要求:要求支持CUDA 13.1。
更新CHARMM36 力场为February 2026版本。
2025/11/23:
更新GROMACS版本至2025.4。
2025/10/10:
升级依赖项:OpenBLAS升级为0.3.30并启用LAPACK编译,hwloc升级为2.12.2。
2025/09/03:
更新GROMACS版本至2025.3。
2025/08/03:
1. 应各位网友要求,更新了新的下载链接,有效期1个月。
2. CUDA版本提升至12.8.1,使用50系显卡的网友可以尝试能否正常运行(我没有50系显卡所以无法测试)。
基于GitHub Actions自动化编译,编译器为Visual Studio 2022内的最新版MSVC,保障与Windows的原生兼容性。
运行的操作系统:Windows 10 64-bit 或 Windows 11。
CPU要求:支持AVX2指令的x86_64 CPU (CUDA版也需要满足)。
集成了 FFTW (3.3.10) OpenBLAS (0.3.31) 和 hwloc (2.13.0)。
集成了 CHARMM36 力场(版本:February 2026)。
使用 OpenMP 并行,没有使用 MPI,因此也无需安装任何MPI库。(因为只考虑单台Windows上多线程并行,所以 OpenMP 可以完全可以满足)
没有集成 PLUMED,也没有集成 libtorch (所以 Neural Network potential 是不支持的)
CPU版本同时包含了单精度的 gmx.exe 和 双精度的 gmx_d.exe 。
CUDA版本只包含单精度的 gmx.exe ,要求系统内安装了 CUDA 13.1.0 或更高版本(因此N卡驱动应该是 591.74 或更高的版本)
关于性能:
我只有一个粗略的结果,仅供参考。
CPU版本:因为MSVC的原因,Windows版显著比Linux版慢很多,所以不建议使用Windows上的CPU版。建议此处提供的CPU版仅用于测试(例如短时间运行测试自己做的tpr能不能跑起来)
CUDA版本:在Windows上原生运行的性能和在WSL中运行Linux版性能几乎一致。与原生Linux系统上运行,大约Windows原生版大约只有90%的性能(也就是说跑5天还是跑5天半的区别)。所以Windows原生的CUDA版GROMACS是完全可以接受的,特别是对于机器有限,不方便装Linux的用户而言。
请确认已安装Microsoft Visual C++ v14 Redistributable (x64)运行时:- https://aka.ms/vc14/vc_redist.x64.exe
复制代码
CUDA版下载(需要登录GitHub账号,有效期至2026/04/10):
(请确定系统内的CUDA版本需要是13.1.0或更高版本)
- https://github.com/KaneGreen/GROMACS-Windows-Builder/actions/runs/22901899884/artifacts/5851212162
- 文件大小:243 MB
- SHA256: 782ce703af0bf7b3319175332466cea227890d536fe99a9981bb127978514cca
复制代码
CPU版下载(需要登录GitHub账号,有效期至2026/04/10):- https://github.com/KaneGreen/GROMACS-Windows-Builder/actions/runs/22913949178/artifacts/5857248050
- 文件大小:23 MB
- SHA256: b8163e34f5e3fbb397c40b303c962097fd13fd7e1a52247a17e91efcc4589c93
复制代码
GitHub项目链接:
- https://github.com/KaneGreen/GROMACS-Windows-Builder
复制代码 欢迎提出issues和PR。
Fork后自行编译的朋友请注意GitHub用户协议,请勿滥用GitHub Actions。
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