分子间轨道重叠的图形显示相位与计算结果相反是什么原因

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在sob老师的博文分子间轨道重叠的图形显示和计算（http://sobereva.com/163）中提到，重叠值为0.00907代表了以正相位重叠，并且在图形显示的时候也是绿色区域居多，大于蓝色区域。
但是我在计算一个dimer的时候，通过博文中提到的两种方式计算得到的HOMO轨道重叠值都是正值，0.00079左右，但是图形显示的时候是蓝色区域居多，代表相反相位重叠居多？

1. 我调整等值面数值，从0.00005到0.00003，图形显示由只有蓝色区域到慢慢出现绿色区域，再小的等值面两种颜色越来越多，不好分辨谁多谁少。我以为最能表现谁多谁少的就应该是0.00005这种等值面，一个不出现，只有一种，就说明出现的这种居多。这样理解对吗？
2. 关于数值正负和颜色显示对不上的情况我第一次遇到，这个不能理解为什么，请问是图形显示出错了吗？

我之后计算了另外两个不同的dimer，他们的数值正负和图形绿蓝是一致的，说明程序是没有问题的，我的计算过程也没有检查出来问题。
还请老师指教，谢谢！

sobereva

并没有必然的矛盾
比如可能负值部分分布比较集中，但是正值部分分布比较弥散、摊得比较开，因此同一个等值面下，可能看上去好像蓝色等值面更显著，但其实正值部分总量更多
你把等值面数值设得更小应该会看到绿色范围明显变得更大

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sobereva 发表于 2018-8-27 20:19
并没有必然的矛盾
比如可能负值部分分布比较集中，但是正值部分分布比较弥散、摊得比较开，因此同一个等值 ...

好的，谢谢Sob老师！