PbS团簇应该怎么建模？通过genmer可以吗？

didida · 发表于 Post on 2018-10-15 19:03:06

请问，这种团簇应该怎么建模？通过genmer可以吗？

我本是个娃娃 · 发表于 Post on 2018-10-15 22:09:01

有那么难吗？

QD1.gjf (489 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 13)

QD2.gjf (1.88 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

QD3.gjf (3.29 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

卡开发发 · 发表于 Post on 2018-10-15 22:53:21

本帖最后由卡开发发于 2018-10-16 06:50 编辑

自己造可以这样造：
1、拿MS或者别的导入一个NaCl格子
2、Na->Pb，Cl->S
3、（QD1）取消周期性边界；（QD2）建立3x3x3超晶格，8个角每个各截去4个原子，取消周期性边界；（QD3）建立3x3x3超晶格，8个角各截去1个原子，取消周期性边界。

coolrainbow · 发表于 Post on 2018-10-15 23:09:11

ABCluster也可以很容易的做这个工作。不过它找的是全局极小点，显然不会是这中八个角都有凹面的结构。只有一个棱

sobereva · 发表于 Post on 2018-10-16 01:05:53

你先找来PbS的晶体结构文件，然后用gview或M$之类延展成较大的复晶胞，保存成结构文件载入到VMD里，然后按照http://bbs.keinsci.com/thread-11104-1-1.html的3L的做法抠出特定半径的球形即可。如果边边角角有不太合适的地方可以在gview里进一步修剪。

注意求助帖应当在帖子标题明确体现出提问、求助（见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html），给你改了，望以后注意

didida · 发表于 Post on 2018-10-16 08:29:40

我本是个娃娃发表于 2018-10-15 22:09
有那么难吗？

谢谢您，刚刚起步学习。

didida · 发表于 Post on 2018-10-16 08:29:55

卡开发发发表于 2018-10-15 22:53
自己造可以这样造：
1、拿MS或者别的导入一个NaCl格子
2、Na->Pb，Cl->S

非常感谢

didida · 发表于 Post on 2018-10-16 08:30:05

coolrainbow 发表于 2018-10-15 23:09
ABCluster也可以很容易的做这个工作。不过它找的是全局极小点，显然不会是这中八个角都有凹面的结构。只有 ...

谢谢

didida · 发表于 Post on 2018-10-16 08:30:40

sobereva 发表于 2018-10-16 01:05
你先找来PbS的晶体结构文件，然后用gview或M$之类延展成较大的复晶胞，保存成结构文件载入到VMD里，然后按 ...

好的，老师，我下次注意，非常感谢老师的回答。

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[建模与可视化] PbS团簇应该怎么建模？通过genmer可以吗？

评分 Rate

浏览过的版块