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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › GROMACS的安装方法（含全程视频演示）
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楼主 Author: sobereva
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[GROMACS] GROMACS的安装方法（含全程视频演示）

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Prof.Huang

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发表于 Post on 2024-6-6 15:35:48 | 只看该作者 Only view this author
老师您好，CentOS 8 Stream 编译2024.2版本的Gromacs报错如下，但是我的GCC版本已经利用gcc-toolset升级到了gcc13版本，为啥还是显示GCC版本过低
CMake Error at cmake/gmxTestCompilerProblems.cmake:69 (message):
  GCC version 9 or later required.  Earlier versions don't have full C++17
  support.
Call Stack (most recent call first):
  CMakeLists.txt:97 (gmx_test_compiler_problems)
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sobereva

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-6 23:56:41 | 只看该作者 Only view this author
mol 发表于 2024-6-6 08:54
谢谢老师，因为之前安装了gpu版本，那这样话流程应该是我再编译一个cpu版本，然后再编译一个cpu的双精度 ...

可以不刻意装CPU单精度版，mdrun运行时直接指定在CPU上跑就完了
双精度版则必须单独装
北京科音自然科学研究中心（http://www.keinsci.com）致力于计算化学的发展和传播，长期开办高质量的各种计算化学类培训：初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班，内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路！培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章！
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”：1号：18616395，2号：466017436，3号：764390338，搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加，合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔，提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog：http://sobereva.com（发布大量原创计算化学相关博文）
Multiwfn主页：http://sobereva.com/multiwfn（十分强大的量子化学波函数分析程序）
ResearchGate：https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
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sobereva

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-7 00:03:01 | 只看该作者 Only view this author
Prof.Huang 发表于 2024-6-6 15:35
老师您好，CentOS 8 Stream 编译2024.2版本的Gromacs报错如下，但是我的GCC版本已经利用gcc-toolset升级到 ...

可能升级方式不对、升级不充分之类。我没升级过
北京科音自然科学研究中心（http://www.keinsci.com）致力于计算化学的发展和传播，长期开办高质量的各种计算化学类培训：初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班，内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路！培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。
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灵芝5

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发表于 Post on 2024-9-9 13:47:29 | 只看该作者 Only view this author
老师，请问gromacs这个安装步骤在Ubuntu 20.04系统下也适用吗？
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发表于 Post on 2024-9-9 13:52:23 | 只看该作者 Only view this author
灵芝5 发表于 2024-9-9 13:47
老师，请问gromacs这个安装步骤在Ubuntu 20.04系统下也适用吗？

跟Ubuntu版本关系不大, 把cmake, fftw之类的跟着教程安装好就行的. 我也是20.04, 跟着教程安装成功了.
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