关于径向分布函数不同峰位置对应的作用力？

ChemiAndy

一整块扣肉 发表于 2022-9-26 13:26
请教一下，不同分子质心之间的RDF怎么求呀，lammps可以求吗?麻烦您解答一下，谢谢啦

质心是各原子坐标的质量加权平均。

假设双原子分子，两原子质量分别为m1, m2， X方向的坐标分别为x1, x2，则其质心在X方向上的值为
x‘=(m1*x1+m2*x2)/(m1+m2)
同理求出Y, Z方向的值，得出质心坐标(x', y', z')。
多原子分子同理。

求A、B分子质心的RDF就是对体系内任意A分子质心，求体系内所有其它B分子质心与A质心距离的概率密度分布。

LAMMPS有没有相应的功能直接计算分子质心RDF我不清楚。建议你自己用shell或者python写个小代码跑一下，会使你对液体结构的核心概念产生深刻的理解。