用Multiwfn+VMD做RDG分析时的一些要点和常见问题

neocc

sobereva 发表于 2022-4-30 07:29
我不知道你说的具体是哪个GUI
以及具体做什么多步操作

抱歉社长，我之前描述的太过笼统。
比方说，在IRI.txt文件中写入
20
4
3 //High quality grid,   covering whole system, about 1728000 points in total
-3
-0.05,-0.03
100
7    //Show isosurface of IRI
0.5

使用multiwfn 1.fchk <IRI.txt 命令，格点计算完后就会弹出等值面图，点击右上角的"RETURN"后，multiwfn就结束运行了。

如果我想进一步调整sign(lambda_2)rho值，只能重新修改IRI.txt的sign(lambda_2)rho范围，然后重新计算格点数据。

希望社长大人 在 "3 High quality grid,   covering whole system, about 1728000 points in total" 之后  加个储存并恢复成原本格点数据的功能。

就可以这样写IRI.txt（如果有三个sign(lamda_2)rho区域需要研究）

在IRI.txt文件中写入
20
4
3    //High quality grid,   covering whole system, about 1728000 points in total
//第一个sign(lamda_2)rho区域
-3
-0.25,-0.23
100
7
0.8   //之后Show isosurface of IRI ，点击右上角的RETURN按键
//第二个sign(lamda_2)rho区域
// 加入回复格点数据的功能
-3
-0.15,-0.13
100
7
0.7  //之后Show isosurface of IRI ，点击右上角的RETURN按键
//第三个sign(lamda_2)rho区域
// 加入回复格点数据的功能
-3
-0.05,-0.03
100
7
0.5
q //退出

sobereva

neocc 发表于 2022-4-30 17:11
抱歉社长，我之前描述的太过笼统。
比方说，在IRI.txt文件中写入
20

我已更新了官网上的Multiwfn最新版本，在用-2或-3改过格点数据后，会出现选项-4用来恢复成原本的格点数据

neocc

sobereva 发表于 2022-5-1 15:21
我已更新了官网上的Multiwfn最新版本，在用-2或-3改过格点数据后，会出现选项-4用来恢复成原本的格点数据

感谢sob大人，五一劳模就是您

lh6576723

Sob老师您好，我做RDG点图的时候，想屏蔽掉分子内部原子之间的点或者spike，只想看到分子与分子之间的相互作用的spike，请问如何操作（vmd的可视图我明白如何做）

sobereva

lh6576723 发表于 2024-1-6 21:27
Sob老师您好，我做RDG点图的时候，想屏蔽掉分子内部原子之间的点或者spike，只想看到分子与分子之间的相互 ...

强烈建议改用IGMH
使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用
http://sobereva.com/621（http://bbs.keinsci.com/thread-28147-1-1.html）