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楼主 Author: sobereva
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[Gaussian/gview] 简谈Gaussian里找过渡态的关键词opt=TS和QST2、3

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发表于 Post on 2020-6-18 21:25:31 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 欢乐多 于 2020-6-19 20:33 编辑
sobereva 发表于 2020-6-17 11:16
从TS跑IRC,直接连通哪个就把哪个当这一步的反应物
谢谢老师!
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发表于 Post on 2020-6-19 16:45:49 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 欢乐多 于 2020-6-19 20:13 编辑
sobereva 发表于 2020-6-17 11:16
从TS跑IRC,直接连通哪个就把哪个当这一步的反应物

老师,您好,
图中E即是我要的产物。从IRC1跑的结果再次优化,得到C;从IRC2跑的结果,再次优化得到D,但是C与D的构象不一样,并且C构象也不能优化到D构象去,我的理解是:
1,以上TS1、C、D、TS2等找的都对。图中C与D构象可以互变,若以C为TS1和TS2的中间体时,TS2的能垒为E4;若以D为中间体时,TS2的能垒为E3,TS1的生成能垒为E1,
2,如果1理解错误,可能就是http://sobereva.com/400博文中提到的“(2)优化的时候由于走得步子太大,或者Hessian矩阵不准确,导致优化到了其它邻近的极小点去。......先把IRC跑得尽量长一些,使两端结构尽可能接近极小点时再做几何优化”,就是说TS1、TS2找对了,但是极小点C或D找的不对。
老师,您看理解是否有问题?

屏幕快照 2020-06-19 下午4.20.22.png (24 KB, 下载次数 Times of downloads: 78)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-21 03:32:33 | 只看该作者 Only view this author
欢乐多 发表于 2020-6-19 16:45
老师,您好,
图中E即是我要的产物。从IRC1跑的结果再次优化,得到C;从IRC2跑的结果,再次优化得到D, ...

当成C和D之间构象变化也需要经历过渡态,作为整个反应中的组成部分
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2026-1-5 23:15:11 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,请问qst2方法,要加noeigen关键词吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-6 00:31:16 | 只看该作者 Only view this author
Dave666 发表于 2026-1-5 23:15
老师您好,请问qst2方法,要加noeigen关键词吗

不需要
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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