量子化学程序Dalton的编译方法和运行方式简介

tianmafei

tianmafei 发表于 2024-6-4 17:59
老师您好！我的系统是Rocky9.4，oneapi2024.1，照着社长的教程编译Dalton 2020.1时，总是卡在
--User se ...

唉，自问自答了。摸索了很久，试着换系统，Rocky9.0或Rocky9.1或Rocky9.4都试过；oneapi也试过2024.1版本或2022版本；结果发现会出现同样的问题，看来似乎与系统或oneapi无关。最后试着在./bashrc文件中加上source /home/个人文件夹/intel/oneapi/mkl/版本号/env/vars.sh以及把编译选项--mkl=sequential去掉，这才编译成了。在build目录下运行ctest命令进行测试，Dalton 2020.1版仅有5个测试结果是Failed。跑个任务也正常进行了，多核并行，小白一枚，不知道串行版mkl库有没有运行。

2877321934

请教老师一个问题，我先前的Dalton是在自己的Ubuntu系统上编译的，我自己的电脑上有cmake，且版本适配，成功编译，但是最近想在服务器Centos7上编译，却遇到麻烦了，服务器上只有cmake3 version 3.17.5而没有cmake，每次我输入./setup --fc=gfortran --cc=gcc --cxx=g++ --mkl=sequential --prefix=/home/Dalton时，就会弹出如下报错

我尝试了几种解决方法，1. 先输入ln -s /usr/bin/cmake3 /usr/bin/cmake，但是还是弹出一样的报错。2 将export PATH=/usr/bin:$PATH加到.bashrc中，也没用。3 改成CMAKE=cmake3 FC=gfortran CC=gcc CXX=g++ ./setup --fc=gfortran --cc=gcc --cxx=g++ --prefix=/home/Dalton，也一样。现在有点没辙了，公共集群上一堆底层编译器又没权限动，想请教一下cmake3能过这一步吗？

sobereva

给本文1.4节末尾加入了Dalton做AMFI计算的bug提醒