双路E5-2699v4，断电重启后仅一路可用

郑汉良很潇洒 · 发表于 Post on 2019-2-19 22:25:55

本帖最后由郑汉良很潇洒于 2019-2-20 08:51 编辑

各位老师，我们实验室的一台服务器是双路E5-2699v4的，每个CPU有22个物理核心，所以我们机子一共44个物理核心，88线程。前不久突然断电，来电重启之后，发现有一个CPU不工作。在使用g16时，使用22线程的速度，与使用44线程的速度几乎差不多，若调用超过44线程，如用%nprocshared=64, 速度仍然几乎差不多。也就是另外一个CPU没有在工作。
检查BIOS里面，发现两个CPU都在线。在teminal 里用lscpu命令查看cpu时，也正确显示的是88线程都在线。但是就是无法调用。请教各位老师有什么解决方法？

njfuzjs · 发表于 Post on 2019-2-19 22:29:51

关闭超线程，再调用44核心试试

njfuzjs · 发表于 Post on 2019-2-19 22:31:38

印象中，G16是不能够用64线程以上吧

郑汉良很潇洒 · 发表于 Post on 2019-2-19 22:31:40

njfuzjs 发表于 2019-2-19 22:29
关闭超线程，再调用44核心试试

好的，谢谢老师！我明天去试试看。

郑汉良很潇洒 · 发表于 Post on 2019-2-19 22:34:54

njfuzjs 发表于 2019-2-19 22:31
印象中，G16是不能够用64线程以上吧

emmm...这个我还不知道。。我平常也不会用这么多，我刚就想试试看是不是另外一个CPU真的不工作。不过看22线程和44线程的结果来看，确实是有一个CPU没有在工作。

sobereva · 发表于 Post on 2019-2-20 00:07:43

正确看待超线程(HT)技术对计算化学运算的影响
http://sobereva.com/392

按此文说的，通过指定%CPU反复测试弄明白是什么情况

郑汉良很潇洒 · 发表于 Post on 2019-2-20 08:33:56

sobereva 发表于 2019-2-20 00:07
正确看待超线程(HT)技术对计算化学运算的影响
http://sobereva.com/392

好的！谢谢社长大大！

niobium · 发表于 Post on 2019-2-20 09:12:02

用那么多线程，速度不变很正常，甚至速度下降都正常

niobium · 发表于 Post on 2019-2-20 09:13:25

这种多核的CPU适合同时交两个作业，但是主频又不怎么高，好尴尬

郑汉良很潇洒 · 发表于 Post on 2019-2-20 09:22:13

niobium 发表于 2019-2-20 09:12
用那么多线程，速度不变很正常，甚至速度下降都正常

总共44个物理核心的话，调用44线程的速度应该是22线程的2倍不到一些，但是这里速度几乎差不多。。。所以我觉得有一半的物理核心没有在工作

dreamyeye · 发表于 Post on 2019-2-20 09:46:00

郑汉良很潇洒发表于 2019-2-20 09:22
总共44个物理核心的话，调用44线程的速度应该是22线程的2倍不到一些，但是这里速度几乎差不多。。。所以 ...

此贴中有过评测：
http://bbs.keinsci.com/thread-11691-1-1.html
同一个计算
E5-2699V4（4*32G内存） %nproc=20 %mem=50GB ：3 min 27 s
E5-2699V4 （4*32G内存）%nproc=44 %mem=100GB：2 min 55 s
2倍不到一些是理想情况吧，真是情况还要考虑到多核并行效率的问题

niobium · 发表于 Post on 2019-2-20 10:00:43

郑汉良很潇洒发表于 2019-2-20 09:22
总共44个物理核心的话，调用44线程的速度应该是22线程的2倍不到一些，但是这里速度几乎差不多。。。所以 ...

不是这样。。这要看程序的并行写得好不好

郑汉良很潇洒 · 发表于 Post on 2019-2-20 10:03:23

dreamyeye 发表于 2019-2-20 09:46
此贴中有过评测：
http://bbs.keinsci.com/thread-11691-1-1.html
同一个计算

我们之前机器没问题的时候，对目前的体系测试过，使用44线程时，elapsed time是2min 20s, 22线程是4min左右, 11线程则是8min 30秒左右。现在44线程耗时4min了，和以前的情况来看确实是少了一半的工作核心

郑汉良很潇洒 · 发表于 Post on 2019-2-20 10:54:23

sobereva 发表于 2019-2-20 00:07
正确看待超线程(HT)技术对计算化学运算的影响
http://sobereva.com/392

社长，我刚测试好。对于目前测试的任务，在机器没问题的情况下，%nprocshared=44时，耗时2min30s, 22线程是4min0s左右, 11线程则是8min20s左右。
0-21,44-65线程是一个socket的，共用22个物理核心的。22-43,66-87另外一个socket，共用另外22物理核心的。
目使用%CPU测试的情况是：%CPU=0-10时，耗时8min16s；%CPU=0-21时，耗时8min30s；%CPU=22-43时，耗时8min30s;%CPU=0-43时，耗时4min30s。所以似乎是两个CPU都在工作，但每个CPU都只能使用一半的物理核心?

tiandikuoyuan · 发表于 Post on 2019-6-11 19:05:43

可以安装i7z监控CPU运行状况

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