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[GROMACS] 有机物晶体熔融模拟的可能性

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我们课题组想要模拟一下有机物晶体在不同温度下在溶剂中的分散状态,实验涉及到熔点附近晶体的破坏过程,请问下有老师做过或者看过这方面的工作么?是如何构建力场参数的?

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发表于 Post on 2019-4-10 15:47:56 | 只看该作者 Only view this author
GAFF就挺不错的,有不少类似的工作都用它,Antechamber就很方便。 CGFF也是可以,在Parachem上面很容易搞定参数。 只是电荷需要弄一下,但是也不难,用Multiwfn的RESP就很方便。 只是说做电荷的时候分子需要考虑一下溶液环境。

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