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[NBO相关] 计算NPA,所得电荷Total与初始设置不一致

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本帖最后由 guo7212c 于 2015-6-25 10:00 编辑

读取opt所得chk文件,设置计算:# b3lyp/6-311+G(d,p) guess=read scrf=(solvent=water) geom=check pop=npa。所得结果出现——row 1957: Total -0.98233,与初始设置(-1)不一致,Mulliken 电荷计算是 -1。原始文件参见附件。 LA-npa.log (116.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 27)

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发表于 Post on 2015-6-25 10:33:22 | 只看该作者 Only view this author
把弥散函数去掉再试,肯定就没问题了。
NBO分析对基组很不敏感,弥散函数更是不需要。而有弥散函数时则容易引入各种数值问题。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-6-25 22:09:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-6-25 10:33
把弥散函数去掉再试,肯定就没问题了。
NBO分析对基组很不敏感,弥散函数更是不需要。而有弥散函数时则容 ...

由于计算资源所限,现在才计算完成。如sob老师所说,去掉弥散函数后,NPA电荷显示正常。谢谢sob老师。
这里还有有个问题,看您的论文《原子电荷计算方法的对比》中提到,NPA并不适合分析静电相互作用。我的目的是分析表面活性剂A(阴离子)的电荷分布情况以及添加阳离子(如Na+)后对其电荷分布的影响,另A与水分子之间的作用情况。按照您所说,此处NPA并不适用,那么选用您后面提到的MK电荷或未提到的Chelpg如何?想确认,分析分子间作用时是否要选用同样的基组(6-311+G**)进行计算?

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发表于 Post on 2015-6-26 05:04:45 | 只看该作者 Only view this author
guo7212c 发表于 2015-6-25 22:09
由于计算资源所限,现在才计算完成。如sob老师所说,去掉弥散函数后,NPA电荷显示正常。谢谢sob老师。
...

此时用NPA问题不大。关键是不能用NPA电荷根据库仑公式去直接计算静电相互作用能,否则误差很大。
复合物和每个片段计算时用的基组应当一致。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-6-26 09:43:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-6-26 05:04
此时用NPA问题不大。关键是不能用NPA电荷根据库仑公式去直接计算静电相互作用能,否则误差很大。
复合物 ...

明白了,NPA计算所得的电荷也就不能用在分子模拟上,谢谢Sob老师,老师注意身体!

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