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[Multiwfn使用咨询] ECDA计算片段A对HOMO的贡献与体系的HOMO在各个片段分布比例相差很大

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楼主
老师,您好。1  我们采用Multiwfn的ECDA模块计算了片段A对HOMO的贡献,发现总贡献约为40%。

2  我们做了HOMO的分布,从HOMO分布图看,很少的分布在片段A上。图形比例约10%。
想问老师,怎么解释这两者差距很大。
计算细节:
G16   TDDFT   cc-pVDZ


谢谢老师。

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发表于 Post on 2019-5-22 03:04:38 | 只看该作者 Only view this author
那个是CDA模块,不是ECDA模块。ECDA只是个给出片段间电荷转移量的分析方法,是CDA模块会顺带做的分析。

要算轨道成份,用下文的做法,用不着CDA模块
谈谈轨道成份的计算方法
http://sobereva.com/131

仅当你要考察片段间电荷转移细节、考察片段轨道是怎么组合成复合物轨道、绘制轨道相互作用图的时候才用得着CDA模块。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-22 11:58:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-22 03:04
那个是CDA模块,不是ECDA模块。ECDA只是个给出片段间电荷转移量的分析方法,是CDA模块会顺带做的分析。

...

谢谢老师的回复,我没有描述清楚问题,我们是考察片段轨道是怎么组合成复合物轨道。片段1-H2O对复合物HOMO贡献为37.25%,而HOMO图中1-H2O所占比例太小。想问下老师这两者是否有可比性,怎么来解释这个差异。


麻烦老师了。



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发表于 Post on 2019-5-22 12:31:22 | 只看该作者 Only view this author
看HOMO其余部分都是什么轨道构成的
注意序号别弄错了,不能带弥散函数
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-22 12:53:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-22 12:31
看HOMO其余部分都是什么轨道构成的
注意序号别弄错了,不能带弥散函数

谢谢sobereva老师。
1  HOMO其余部分主要分布在片段CO2上,约为43.52%。但从图形上看,绝大部分HOMO分布在片段CO2。
2  我们用的基组为cc-pVDZ (相当于6-31G**级别),HOMO作图也是该基组计算得到的fchk。
3  原子序号检查了,分析时没有出错。

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发表于 Post on 2019-5-22 14:00:02 | 只看该作者 Only view this author
dlut211 发表于 2019-5-22 12:53
谢谢sobereva老师。
1  HOMO其余部分主要分布在片段CO2上,约为43.52%。但从图形上看,绝大部分HOMO分布 ...

没相关细节没法回复
相关文件压缩后上传,如果压缩后超过3MB,传到网盘里
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-23 11:20:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-22 14:00
没相关细节没法回复
相关文件压缩后上传,如果压缩后超过3MB,传到网盘里

附件中包含:HOMO、轨道组成、体系和各个片段的fchk文件。
谢谢老师。

轨道组成-HOMO-结构文件.rar

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发表于 Post on 2019-5-24 05:03:59 | 只看该作者 Only view this author
dlut211 发表于 2019-5-23 11:20
附件中包含:HOMO、轨道组成、体系和各个片段的fchk文件。
谢谢老师。

fragment-3里的是log文件不是fchk文件,我没法考察
scf=qc这种关键词尽量不要用,不仅慢还容易收敛到不稳定波函数
每个片段的gjf也一起上传
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-24 10:06:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-24 05:03
fragment-3里的是log文件不是fchk文件,我没法考察
scf=qc这种关键词尽量不要用,不仅慢还容易收敛到不 ...

感谢老师的耐心回复,重新准备了文件,请您查阅。

HOMO-轨道组成-体系和各个片段的gjf和fchk文件.rar

396.58 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

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发表于 Post on 2019-5-25 03:58:21 | 只看该作者 Only view this author
dlut211 发表于 2019-5-24 10:06
感谢老师的耐心回复,重新准备了文件,请您查阅。

你的片段里的原子顺序和整体不一样,此时没法做CDA
你的复合物里CO2的原子序号是1、2、4,但是CO2片段的文件里它们是挨着的,所以依次载入每个片段后对应的原子顺序和整体不符,这势必会导致分析结果错乱
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sobereva 发表于 2019-5-25 03:58
你的片段里的原子顺序和整体不一样,此时没法做CDA
你的复合物里CO2的原子序号是1、2、4,但是CO2片段的 ...

谢谢老师,按照您说的,已解决。

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