退火扩散系数计算问题

wuyiyyyy · 发表于 Post on 2019-9-27 16:41:10

各位我用MS的forcite模块计算分子动力学，得到的xtd文件用analysis分析后可以得到扩散系数
但是我用了forcite模块的退火功能，结果就不能分析出错
no time information is available for trajectories created by anneals or quenched dynamics
但是退火应该有时间吧

少年爱吃地三鲜 · 发表于 Post on 2019-9-27 18:55:05

他是根据什么算的扩散系数? 均方位移还是速度自相关?

sobereva · 发表于 Post on 2019-9-28 03:06:48

考察扩散系数理应是体系处于平衡的状态，温度发生变化的过程去统计扩散系数没有意义

wuyiyyyy · 发表于 Post on 2019-9-29 14:27:17

少年爱吃地三鲜发表于 2019-9-27 18:55
他是根据什么算的扩散系数? 均方位移还是速度自相关?

根据均方位移 MSD

wuyiyyyy · 发表于 Post on 2019-9-29 14:28:33

sobereva 发表于 2019-9-28 03:06
考察扩散系数理应是体系处于平衡的状态，温度发生变化的过程去统计扩散系数没有意义

那么先升温一个梯度达到平衡后计算扩散系数
然后再升温？

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