GROMACS运行报错Illegal instruction

snow_wl · 发表于 Post on 2019-10-6 14:11:31

老师你好，本人初学GROMACS，我们服务器已经安装gromacs(2018.4.knl)，为什么我运行gmx_sp 等命令 (如gmx_sp solvate -box 3 3 3 -o h2o.gro)一直报错Illegal instruction呢？

bobosiji · 发表于 Post on 2019-10-6 15:24:05

没安装好。或者这个gmx编译的CPU和你现在运行gmx的CPU很不一样（比如开了avx512加速的gold vs E5）

sobereva · 发表于 Post on 2019-10-7 07:00:21

gmx_sp、2018.4.knl是什么鬼
严格按照此文在你的服务器上编译gromacs，什么问题也不会有。别把别的机子编译的直接拷来用

GROMACS的安装方法（含全程视频演示）
http://sobereva.com/457（http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html）

snow_wl · 发表于 Post on 2019-10-7 10:06:37

bobosiji 发表于 2019-10-6 15:24
没安装好。或者这个gmx编译的CPU和你现在运行gmx的CPU很不一样（比如开了avx512加速的gold vs E5）

谢谢了，我自己重新安装了一个，这回能用了

snow_wl · 发表于 Post on 2019-10-7 10:07:16

sobereva 发表于 2019-10-7 07:00
gmx_sp、2018.4.knl是什么鬼
严格按照此文在你的服务器上编译gromacs，什么问题也不会有。别把别的机子编 ...

听从老师指挥，自己安装了一个这回可以了

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