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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 谈谈如何衡量分子的极性

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发表于 Post on 2025-12-27 16:36:12 | 只看该作者 Only view this author
真是一篇非常出色的介绍!现在我想知道运用MPI方法衡量分子极性时,能否将极性表面和非极性表面进行可视化呢按照文中的定义?谢谢sob老师!!!!

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发表于 Post on 2025-12-27 16:37:25 | 只看该作者 Only view this author
Chess1357 发表于 2025-12-27 16:36
真是一篇非常出色的介绍!现在我想知道运用MPI方法衡量分子极性时,能否将极性表面和非极性表面进行可视化 ...

另外生物大分子比如核酸蛋白质,也可以参照文中的方法进行MPI计算吗?期待指点,谢谢!!!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-28 14:26:38 | 只看该作者 Only view this author
Chess1357 发表于 2025-12-27 16:36
真是一篇非常出色的介绍!现在我想知道运用MPI方法衡量分子极性时,能否将极性表面和非极性表面进行可视化 ...

Multiwfn主功能12对静电势分析完后,后处理菜单选择导出表面顶点成为vtx.pqr,放到VMD里显示,选择语句按照charge属性(当前对应于静电势)设置。诸如选择语句用charge < -0.03 代表只显示表面静电势值< -0.03 a.u.的表面顶点部分。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-28 14:29:15 | 只看该作者 Only view this author
Chess1357 发表于 2025-12-27 16:37
另外生物大分子比如核酸蛋白质,也可以参照文中的方法进行MPI计算吗?期待指点,谢谢!!!

原理上对于任意分子都可以。但是巨大的生物分子体系基于波函数算静电势算不动,只能基于原子电荷算,如下文
基于原子电荷极快速绘制超大体系的分子表面静电势图
http://sobereva.com/639http://bbs.keinsci.com/thread-28913-1-1.html

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