计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 11498|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 想利用模拟软件分子凝胶因子与油之间的作用力,可行吗

[复制链接 Copy URL]

5

帖子

0

威望

17

eV
积分
22

Level 1 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
看到文献做水凝胶的,显示模拟出凝胶因子的聚合物,然后将水分子添加进聚合物中,如果想利用模拟软件看凝胶银子与油之间的作用力,可行吗?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125127

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2019-10-31 16:20:21 | 只看该作者 Only view this author
你研究的这种具体问题我不熟悉。不过使用GROMACS,模拟银单质+油这种体系很容易,跑出来轨迹之后想怎么分析就怎么分析
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

5

帖子

0

威望

17

eV
积分
22

Level 1 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-4 09:37:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-10-31 16:20
你研究的这种具体问题我不熟悉。不过使用GROMACS,模拟银单质+油这种体系很容易,跑出来轨迹之后想怎么分析 ...

那油这种体系很复杂  我是要自己画分子式各自优化 然后将他们混合在一起 搞出一个油体系 还是直接就可以导出一个油体系呀 。 您说的单质和油体系的 是哪篇文章 可以告诉我吗 我自己看看 谢谢啦

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125127

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2019-11-4 09:42:15 | 只看该作者 Only view this author
要顺利毕业呀 发表于 2019-11-4 09:37
那油这种体系很复杂  我是要自己画分子式各自优化 然后将他们混合在一起 搞出一个油体系 还是直接就可以 ...

packmol就可以建
分子动力学初始结构构建程序Packmol的使用
http://sobereva.com/473http://bbs.keinsci.com/thread-12549-1-1.html

J. Phys. Chem. C 2008, 112, 17281–17290给了典型适合在gmx里模拟金属的势,此文里用到了
在Gromacs中模拟金纳米线拉伸过程(含视频)
http://sobereva.com/153
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

5

帖子

0

威望

17

eV
积分
22

Level 1 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-4 09:49:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-4 09:42
packmol就可以建
分子动力学初始结构构建程序Packmol的使用
http://sobereva.com/473(http://bbs.kein ...

感谢您~

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-19 07:06 , Processed in 0.207475 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list