计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 7326|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] 使用multiwfn计算福井函数,得到的电子云密度图错位

[复制链接 Copy URL]

8

帖子

0

威望

71

eV
积分
79

Level 2 能力者

使用multiwfn计酸福井函数, 计算用分子已经事先用Gaussian 优化,通过《 使用Multiwfn超级方便地计算出概念密度泛函理论中定义的各种量》 计算得到的福井函数图见附件,求教大神!跪求 !


6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120160

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2019-11-21 17:32:27 | 只看该作者 Only view this author
福井函数和电子云密度完全是两码事,应该说密度差
较大可能是你用的输入的wfn文件中原子坐标不对应
把详细操作过程,用到的输入文件都压缩后上传(较大的话传到网盘),我需要重现你的计算才能说清楚
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

8

帖子

0

威望

71

eV
积分
79

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-21 18:15:46 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,我把用到的fch. wfn.文件都已上传,0.fch是优化后的分子。用到的具体操作是按照http://bbs.keinsci.com/thread-13328-1-1.html使用Multiwfn超级方便地计算出概念密度泛函理论中定义的各种量》操纵计算的福井函数,然后生成了cub文件,在VMD里观察渲染的

新建文件夹.7z

926.8 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120160

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2019-11-21 22:47:44 | 只看该作者 Only view this author
我用你的wfn文件,没发现有问题,得到的f-福井函数的0.003等值面如下,和Multiwfn程序里直接显示的也一致



计算过程的输出信息我都放在附件里了,供对照。如果用的不是Multiwfn最新版本,先尝试最新版本。

output.txt

6.36 KB, 下载次数 Times of downloads: 6

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

8

帖子

0

威望

71

eV
积分
79

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-22 18:05:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-21 22:47
我用你的wfn文件,没发现有问题,得到的f-福井函数的0.003等值面如下,和Multiwfn程序里直接显示的也一致
...

我下载了最新版本的Multiwfn,显示的是正确的了,应该是版本问题,多谢Sob老师!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-16 16:57 , Processed in 0.191335 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list