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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 计算分子内氢键键能的几种方法

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-7 22:47:05 | 只看该作者 Only view this author
陈AG 发表于 2025-8-7 17:52
老师,对于绿色这根金属配位键,您说“LBO不适合用于含有第四周期及之后元素的成键”,那我可 ...

我不知道你想“算”什么。如果比如你对这三个体系用Multiwfn做AIM拓扑分析,通过对绿色这个键对应的BCP的性质对比键的强度差异,完全可以。
实际上如果是用于描述类似体系间同一个键的键强弱差异,LBO也可以用,并且也可以有挺好的相关性。近来一个同行他发现,不同配体(都是N配位)与Ru的LBO,与配体的Hammet sigma参数有很好的相关性。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-8-8 09:01:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-8-7 22:47
我不知道你想“算”什么。如果比如你对这三个体系用Multiwfn做AIM拓扑分析,通过对绿色这个键对应的BCP的 ...

老师不好意思,我没描述清楚,这三个分子是有机电致发光材料,我想算他们的绿色配位键的BDE,来对比他们在有机电致发光器件中的稳定性,但是我学习了http://bbs.keinsci.com/thread-600-3-1.html里面的讨论之后,感觉只算BDE的话,和他们在器件中的稳定性恐怕不会有良好的正相关关系。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-8 15:13:22 | 只看该作者 Only view this author
陈AG 发表于 2025-8-8 09:01
老师不好意思,我没描述清楚,这三个分子是有机电致发光材料,我想算他们的绿色配位键的BDE,来对比他们 ...

如果你已有实验数据,可以做个相关性分析。如果没有实验数据而光用这个理论信息来预测的话,依据不十分充分,至少讨论的时候别把话说死了
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发表于 Post on 2025-8-8 15:18:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-8-8 15:13
如果你已有实验数据,可以做个相关性分析。如果没有实验数据而光用这个理论信息来预测的话,依据不十分充 ...

好,感谢sob大大

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发表于 Post on 2025-11-7 11:47:29 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 陈AG 于 2025-11-7 13:49 编辑
sobereva 发表于 2025-8-7 22:47
我不知道你想“算”什么。如果比如你对这三个体系用Multiwfn做AIM拓扑分析,通过对绿色这个键对应的BCP的 ...

sob老师,对于类似体系,我对比了8个Pt-C配位键,发现LBO键级和Mayer键级一致(1>5>6>8>3>4>7>2),但是和AIM的 ρ(BCP)(7>6>4>2>8>5>1>3)结果不一致,那应该以哪个为准呢?还说说AIM分析不能只看ρ(BCP)的大小,也要结合V(BCP)( Potential energy density V(r): )的负值来看呢,怎么结合呢?Multiwfn支持的分析化学键的方法一览 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-7 22:42:44 | 只看该作者 Only view this author
陈AG 发表于 2025-11-7 11:47
sob老师,对于类似体系,我对比了8个Pt-C配位键,发现LBO键级和Mayer键级一致(1>5>6>8>3>4>7>2),但是和 ...

你可以算算V(BCP)和H(BCP)看看都是什么情况
相对于光看ρ(BCP),LBO/Mayer键级的结果可靠度大概率更高一些,毕竟ρ(BCP)仅仅是三维空间一个点的电子密度而已,蕴含的信息很有限。
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发表于 Post on 2025-11-8 18:00:35 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 陈AG 于 2025-11-8 18:03 编辑
sobereva 发表于 2025-11-7 22:42
你可以算算V(BCP)和H(BCP)看看都是什么情况
相对于光看ρ(BCP),LBO/Mayer键级的结果可靠度大概率更高一 ...

老师,对于有机分子,因为BDE计算比较费时,我们原本打算基于以下的计算结果用键级来判断键稳定性(中性基态S0:opt freq b3lyp 6-31G* em=gd3bj;阴离子基态S0-:opt freq b3lyp 6-31G* em=gd3bj  -1 2;阳离子基态S0+:opt freq b3lyp 6-31G* em=gd3bj  1 2),这两天我比较了一下算出来的BDE,和LBO/Mayer/AIM分析结果比较,四个分子,9根键,发现那四个数完全没有规律哎,BDE大,LBO/Mayer/AIM三个有大有小,而且,LBO和Mayer甚至都没有趋势一致。
问题1:这种情况是正常的吗,我学习了一下,是不是四个参数都有道理,不能说他们错误,只能说是不同的原理导致的?
问题2:那这种情况下,有什么更好的方法吗,还是说非环状结构可以算BDE的就算BDE,算不了的就LBO,

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-8 23:31:23 | 只看该作者 Only view this author
陈AG 发表于 2025-11-8 18:00
老师,对于有机分子,因为BDE计算比较费时,我们原本打算基于以下的计算结果用键级来判断键稳定性(中性 ...

这些配体的那点差异对配位键强度的影响,相对于总强度来说微乎其微,不同方法吻合不上很正常。也没必要非要给个强度顺序,本来就都差不多。而且不是什么情况都能算BDE,不是耗时高低的事,是根本没法严格计算。
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