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[Gaussian/gview] gaussian计算500个左右原子体系的能量为什么会出现内存错误?

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楼主
各位老师,我用gaussian计算一个500个原子体系的单点能,方法特意选了HF,不算频率,内存和CPU大大小小,或者不指定,各种试,无论在自己服务器还是超算中心算总是出现内存错误,配置的内存应该都是够的,这种情况是为什么呢?请大家帮忙看一下是方法软件不适合这么大体系还是有别的问题呢?S atom may be hypervalent but has no d functions.是什么意思? 有影响吗?谢谢!
输入:
%chk=A1.chk
#p hf/6-31g
Title Card Required
0 1
输出:
Warning!  S  atom   66 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  408 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  409 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  423 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  424 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  438 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  439 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  453 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  454 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  468 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  469 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  483 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  S  atom  484 may be hypervalent but has no d functions.

IExCor=    0 DFT=F Ex=HF Corr=None ExCW=0 ScaHFX=  1.000000
ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000 ScalE2=  1.000000  1.000000
IRadAn=      0 IRanWt=     -1 IRanGd=            0 ICorTp=0
NAtoms=  496 NActive=  496 NUniq=  496 SFac= 7.50D-01 NAtFMM=   80 NAOKFM=T Big=T
Leave Link  301 at Fri Mar 27 17:04:11 2020, MaxMem=   33554432 cpu:       0.0
(Enter /public1/home/sc50754/g09/l302.exe)
NPDir=0 NMtPBC=     1 NCelOv=     1 NCel=       1 NClECP=     1 NCelD=      1
         NCelK=      1 NCelE2=     1 NClLst=     1 CellRange=     0.0.
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis=  3124 RedAO= T  NBF=  3124
NBsUse=  3124 1.00D-06 NBFU=  3124
Leave Link  302 at Fri Mar 27 17:05:16 2020, MaxMem=   33554432 cpu:      64.1
(Enter /public1/home/sc50754/g09/l303.exe)
DipDrv:  MaxL=1.
Out-of-memory error in routine ShPair-CalcS2-2 (IEnd=      15962994 MxCore=      14029431)
Use %mem=34MW to provide the minimum amount of memory required to complete this step.
Error termination via Lnk1e in /public1/home/sc50754/g09/l303.exe at Fri Mar 27 17:05:17 2020.
Job cpu time:  0 days  0 hours  1 minutes  4.9 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    491 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1





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发表于 Post on 2020-3-27 17:38:27 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2020-3-27 17:43 编辑

Terrible。反面教材典型。。。
(1)hf/6-31g是自己玩着用的,产生垃圾结果,没有发表价值。还“方法特意选了HF”。。。
(2)没有指定核数、没有指定内存=偏偏有内力却封住不用。
(3)6-31G对S来讲没有d函数,所以你会出现这种警告,如果这句中文还是不理解,说明需要学习基组知识。。。
你就算用万金油搭配B3LYP/6-31G(d) em=GD3BJ也不至于这步田地。。。

赶紧看Sob老师博文学习吧
《谈谈量子化学中基组的选择》http://sobereva.com/336
《简谈量子化学计算中DFT泛函的选择》http://sobereva.com/272

自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2020-3-28 05:03:54 | 只看该作者 Only view this author
提示写得已经超级明白了
Use %mem=34MW to provide the minimum amount of memory required to complete this step.

看此文了解Gaussian的运行资源的设定常识
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-30 10:05:46 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-3-27 17:38
Terrible。反面教材典型。。。
(1)hf/6-31g是自己玩着用的,产生垃圾结果,没有发表价值。还“方法特意 ...

可以正常运行了,谢谢!去学习了~

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-30 10:06:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-3-28 05:03
提示写得已经超级明白了
Use %mem=34MW to provide the minimum amount of memory required to complete t ...

谢谢社长!可以运行了。

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发表于 Post on 2020-5-17 07:06:30 | 只看该作者 Only view this author
请问具体是怎么解决的啊?

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发表于 Post on 2020-8-28 16:23:02 | 只看该作者 Only view this author
涓涓流水 发表于 2020-3-30 10:05
可以正常运行了,谢谢!去学习了~

请问如何解决这个难题的?

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发表于 Post on 2021-4-27 20:52:42 | 只看该作者 Only view this author
请问怎么解决这个难题的

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发表于 Post on 2021-4-27 21:36:57 | 只看该作者 Only view this author
雪见容馥 发表于 2021-4-27 20:52
请问怎么解决这个难题的

从哪里看出这是个难题的

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Icestone + 2 正解
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发表于 Post on 2021-4-28 16:33:07 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2021-4-27 21:36
从哪里看出这是个难题的

对于小白来说算是难处理吧

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发表于 Post on 2021-5-3 02:44:57 | 只看该作者 Only view this author
雪见容馥 发表于 2021-4-27 20:52
请问怎么解决这个难题的

但凡输出信息里都十分明确给你答案的自然就不是难题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-6-2 12:47:05 | 只看该作者 Only view this author

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