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[GROMACS] 请教CO2粘度计算问题

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请教老师通过非平衡NPT 先模拟了H2O的粘度计算,fourierspacing = 0.16;cos_acceleration =0.025;g_energy显示的结果还算可以吧。
但是换成CO2体系,CO2 无虚拟位点,设定40度10MPa,运行到一定程度就出错,改变了cos_acceleration 值,降低至0.001时,可以长时间运行,但是波动仍很大。我搜索了相关gromacs 粘度计算的帖子,还是没能解决这个问题,希望老师们指教。
请问这是cos_acceleration 数值设置问题导致的么?
请问常用的CO2粘度计算是这样做么?

谢谢!


CO2 viscosity cos_acceleration =0.001.jpg (132.44 KB, 下载次数 Times of downloads: 23)

CO2 0.001,上图粘度下图压力

CO2 0.001,上图粘度下图压力

CO2 viscosity cos_acceleration =0.01.jpg (117.36 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

CO2 0.01

CO2 0.01

H2O viscosity.jpg (243.3 KB, 下载次数 Times of downloads: 18)

H2O

H2O

vis.mdp

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-5 05:21:14 | 只看该作者 Only view this author
有没有做过相关研究的大神,求指导

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