[GROMACS] 求助：计算电生理学镜像模型下跨膜电位和Δq不匹配的问题

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昊彦祖

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发表于 Post on 2020-6-22 15:31:11 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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各位老师，我目前用计算电生理学镜像模型模拟钾离子通过Kv1.2钾离子通道（通道蛋白只保留了S5-S6螺旋段，带-8e的电荷，不包括VSD区域），目前遇到的问题是：
单层膜/蛋白体系的上下水溶液的净电荷之差差异很大，构建平移双膜之后，A,B区域的净电荷都为零了，之后再设Δq=4e之后，跨膜电位为几百毫伏，可以正常模拟；
但构建镜像模型之后，A,B区域的净电荷之差扩大一倍，Δq在负值时，跨膜电位却为正值，但并没有离子通过通道，如图：

请问Δq和跨膜电位不匹配的原因可能出在哪

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