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[GROMACS] 用什么参数表征界面膜的稳定程度

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各位老师好,最近在用gromacs模拟表面活性剂界面体系,请问有什么参数可以表示该界面的稳定性吗?

比如rmsf之类的?请各位老师指点。

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发表于 Post on 2020-7-1 19:55:31 | 只看该作者 Only view this author
不知道你的界面是平的还是球形的(囊泡)
这两种情况可以分别拟合个平面或者球面,统计下每一帧这些表面活性剂位置偏离平面或球面的RMSD
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-2 09:33:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-1 19:55
不知道你的界面是平的还是球形的(囊泡)
这两种情况可以分别拟合个平面或者球面,统计下每一帧这些表面活 ...

多谢sob老师提供思路,目前研究的是球形的胶束

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