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[GROMACS] 求助关于温度耦合中控温器与分组的问题

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本帖最后由 zhangzh 于 2020-7-9 01:59 编辑

有时候在输入文件的示例中看到这样给两组分别控温的例子,请问什么时候需要分别控温呢?分别控温的作用是什么?
  1. Tcoupl      = Nose-Hoover
  2. tc_grps     = Protein   Non-Protein
  3. tau_t       = 0.5       0.5
  4. ref_t       = 310       310
复制代码
以及各种控温/压器(V-rescale,N-H,andersen,berendsen)(berendsen,P-R,MTTK)应该如何选用?它们的适用范围是什么呢


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2#
发表于 Post on 2020-7-9 05:08:45 | 只看该作者 Only view this author


上面幻灯片里没提的热浴在实际中都没必要考虑。

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