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[Amber] 求助QM/MM执行后配置文件解析问题

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楼主

我在进行QM/MM模拟时,执行命令后
sander -O -i DLP-qm-min.in -o DLP-qmmm-min.out -c DLP-equil-499-cut-wat.inpcrd -p DLP-equil-499-cut-wat.prmtop -r DLP-qmmm-min.rst
配置文件被解析出来,不知为何?我没有安装GASSIAN16,用的是G09,虽然能正常计算。
不知如何禁止配置文件解析?非常感谢。

which: no g16 in (/home/xzhfood/amber2018/amber18/bin:/usr/local/gromacs-2020gaus/bin:/opt/openmpi-4.0/bin:/opt/intel/composer_xe_2015.2.164/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2015.2.164/debugger/gdb/intel64_mic/bin:/opt/intel/composer_xe_2015.2.164/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2015.2.164/debugger/gdb/intel64_mic/bin:/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.3.199/linux/bin/intel64:/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144/linux/mpi/intel64/libfabric/bin:/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144/linux/mpi/intel64/bin:/opt/mpich-install/bin:/opt/cmake-3.14.0/bin/:/opt/intel//impi/5.0.3.048/intel64/bin:/usr/local/bin:/usr/local/sbin:/usr/bin:/usr/sbin:/bin:/sbin:/usr/local/cuda-9.2/bin:。。。。。。。。。。。。。。。。

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发表于 Post on 2020-7-10 21:39:14 | 只看该作者 Only view this author
%gau里用executable指定当前是要找g09,还不行的话自行把g09可执行文件所在目录加到$PATH里
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-10 21:56:33 | 只看该作者 Only view this author
多谢SOB老师指点,%gau里用executable = g09 问题解决。

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