计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 13483|回复 Reply: 10
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[其它程序] 求助VOTCA软件的安装编译

[复制链接 Copy URL]

32

帖子

0

威望

2252

eV
积分
2284

Level 5 (御坂)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师好!

本人最近看到一款软件,很是感兴趣,名为VOTCA,开源软件,看简介可以进行粗粒化模拟,还能算电荷传输和激子传输。但是安装中发现安装过程太复杂了,需要编译,我这个小白搞不定了。
以下为软件官网 http://www.votca.org/
各位老师谁能编译和使用此软件,请教教我,不胜感激!


生命不息,折腾不止!

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125148

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2020-7-15 19:56:09 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反映出帖子具体内容,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“VOTCA软件”改了,以后务必注意,下次将扣分处理。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

126

帖子

0

威望

3649

eV
积分
3775

Level 5 (御坂)

アルトリア・ペンドラゴン

3#
发表于 Post on 2020-7-15 21:56:54 | 只看该作者 Only view this author

32

帖子

0

威望

2252

eV
积分
2284

Level 5 (御坂)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-16 08:32:22 | 只看该作者 Only view this author
njfuzjs 发表于 2020-7-15 21:56
https://github.com/votca/votca/blob/master/share/doc/INSTALL.rst
这不就是安装方法吗?

我是按照这个方法安装的,但是前期的cmake编译器的安装和依赖库的安装对我这个新手来说有点难,总会报错,一个错误就要花大量时间来解决。
生命不息,折腾不止!

513

帖子

0

威望

4388

eV
积分
4901

Level 6 (一方通行)

truffle

5#
发表于 Post on 2020-7-16 09:43:10 | 只看该作者 Only view this author
胖鱼加加 发表于 2020-7-16 08:32
我是按照这个方法安装的,但是前期的cmake编译器的安装和依赖库的安装对我这个新手来说有点难,总会报错 ...

系统自带的cmake应该可以直接用吧
参考http://sobereva.com/457
No problem is insoluble in all conceivable circumstances.

79

帖子

0

威望

1325

eV
积分
1404

Level 4 (黑子)

6#
发表于 Post on 2020-7-21 21:17:22 | 只看该作者 Only view this author
照着github的官方安装方法(3L给的网址),用Ubuntu系统(尝试过CentOS,似乎不行),一行命令安装完所有依赖包。
cmake安装3.12就行了,sobereva老师的gromacs安装教程里就有安装方法(楼上给的网址),百度一搜也一大堆。
安装完VOTCA的依赖包,后面照着github的输命令就可以了

4289

帖子

4

威望

9546

eV
积分
13915

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

7#
发表于 Post on 2020-7-21 21:27:05 | 只看该作者 Only view this author
CMakeLists.txt文件里第一行就写得很清楚cmake_minimum_required(VERSION 3.10)
自动做多参考态计算的程序MOKIT

32

帖子

0

威望

2252

eV
积分
2284

Level 5 (御坂)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-13 10:48:47 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 胖鱼加加 于 2020-10-13 11:01 编辑
@Bruce 发表于 2020-7-21 21:17
照着github的官方安装方法(3L给的网址),用Ubuntu系统(尝试过CentOS,似乎不行),一行命令安装完所有依 ...

前辈,我按照你说的方式安装好了VOTCA-XTP,但是没有使用说明书,想尝试这运行里面的例子./run.sh,报错
xtp_run: command not found
是因为没有设置环境变量吗?安装说明中没有讲如何设置环境变量,请问前辈是否有遇到过此问题?还是我的思路不对?
生命不息,折腾不止!

32

帖子

0

威望

2252

eV
积分
2284

Level 5 (御坂)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-13 17:21:38 | 只看该作者 Only view this author
@Bruce 发表于 2020-7-21 21:17
照着github的官方安装方法(3L给的网址),用Ubuntu系统(尝试过CentOS,似乎不行),一行命令安装完所有依 ...

前辈,VOTCA环境变量的问题我自己捣鼓明白了,现在开始尝试进行算例的运算 xtp-tutorials/GROMACS/Methane遇到了新的问题就是输出文件报错,具体out信息见附件,我觉得最应该解决的两个问题是以下两个
terminate called after throwing an instance of 'std::runtime_error'
  what():  VOTCASHARE not set, cannot open help files.但是不知道如何解决,还望高人指点,感激不尽。


out.log

21.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

生命不息,折腾不止!

4

帖子

0

威望

57

eV
积分
61

Level 2 能力者

10#
发表于 Post on 2021-4-27 22:20:15 | 只看该作者 Only view this author
你好,我按照网站上的教程在centos上安装了,显示安装成功了,但是找不到安装在哪,您现在还做这个吗?能不能交流一下?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125148

管理员

公社社长

11#
发表于 Post on 2021-5-3 02:59:06 | 只看该作者 Only view this author
麦克列 发表于 2021-4-27 22:20
你好,我按照网站上的教程在centos上安装了,显示安装成功了,但是找不到安装在哪,您现在还做这个吗?能不 ...

大多数程序没指定安装路径的话都会装到/usr/local/bin下面。对/usr包括子目录搜搜便知
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-22 19:19 , Processed in 0.240729 second(s), 30 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list