Quantum ESPRESSO在Linux下的安装方法

wth1219 · 发表于 Post on 2021-12-25 11:43:51

jiangning198511 发表于 2021-12-24 16:15
可以用cif2qe

谢谢老师指教！我去试着用一下。

wth1219 · 发表于 Post on 2021-12-25 11:44:35

Freeman 发表于 2021-12-24 22:52
http://bbs.keinsci.com/thread-20166-1-1.html

多谢老师指教！这个很强大！

wtz1013703083 · 发表于 Post on 2022-2-27 15:57:53

大佬，用你的diamond测试的时候出现这种报错怎么解决呢。。。
[proxy:0:0@node01] HYDU_create_process (../../utils/launch/launch.c:588): execvp error on file pw.x (No such file or directory)
[proxy:0:0@node01] HYDU_create_process (../../utils/launch/launch.c:588): execvp error on file pw.x (No such file or directory)
[proxy:0:0@node01] HYDU_create_process (../../utils/launch/launch.c:588): execvp error on file pw.x (No such file or directory)
[proxy:0:0@node01] HYDU_create_process (../../utils/launch/launch.c:588): execvp error on file pw.x (No such file or directory)

vivixjw · 发表于 Post on 2022-4-12 09:38:09

本帖最后由 vivixjw 于 2022-4-12 09:47 编辑

社长，您好，按照您的方法安装QE后，在测试提交diamond任务时出现了图中的错误，请问应该怎么解决。

这是我添加的路径

nusiew · 发表于 Post on 2022-10-30 23:10:47

tanyazhi 发表于 2020-10-31 14:39
1、按照社长的教程，目前已经成功安装qe6.5，后期准备再试一下qe6.6，root账户和普通账户都可以安装成功 ...

我也出现上面提到的bin目录是空的问题，感谢分享！

hzliew · 发表于 Post on 2022-11-28 17:26:53

QE分别Intel MPI和OpenMPI，哪个更快啊

霹雳神偷 · 发表于 Post on 2022-11-28 17:34:35

本帖最后由霹雳神偷于 2022-11-30 11:53 编辑

太好了，看着社长的贴子编好了！在这里要提醒一点，QE-7.1和libxc6.0.0不匹配。会造成编译失败的问题。想用libxc的小伙伴一定要去下载5.2.2以前的版本的。这个着实把我坑了好久。

hzliew · 发表于 Post on 2022-11-28 18:47:55

希望有大佬能贴出完整的GPU版QE的安装步骤

霹雳神偷 · 发表于 Post on 2022-11-30 11:53:37

本帖最后由霹雳神偷于 2022-11-30 12:05 编辑

社长，我费了很大的劲编译成功了，安装也安装好了，但最后测试的时候还是不行。
现在情况是这样的，在root下运行测试文件它直接显示无法在库中找到这个文件，但是事实是mpi路径下是有这一个名字的文件的。

然后我怀疑是.bashrc下root运行mpi没设置好，于是我试了一下非root下运行测试文件。结果还是不行....但是显示变成这样了。

请问应该怎么解决。
我的.bashrc里面这四句话是这样的。

我用的系统是Rocky linux 8.7。

snljty2 · 发表于 Post on 2022-11-30 14:04:57

hzliew 发表于 2022-11-28 18:47
希望有大佬能贴出完整的GPU版QE的安装步骤

《CentOS下GPU加速版QE的编译安装》论坛首页随便一搜就能找到。

yulonghai · 发表于 Post on 2023-3-18 21:30:52

霹雳神偷发表于 2022-11-28 17:34
太好了，看着社长的贴子编好了！在这里要提醒一点，QE-7.1和libxc6.0.0不匹配。会造成编译失败的问题。想用 ...

您好，可以具体描述有一下不匹配的问题吗？我用的也是QE-7.1
Warning: Type mismatch between actual argument at (1) and actual argument at (2) (COMPLEX(8)/REAL(8)).
编译的时候一堆这种warning,不知道是不是你提到的不匹配。
测试的时候基本全error。

hdb · 发表于 Post on 2023-4-28 11:06:06

本帖最后由 hdb 于 2023-5-10 16:55 编辑

QE编译血泪史，搞了很久，因为系统配置了很多软件，环境很多又很乱，没做环境隔离，所以想分享几个编译的关键点：

编译环境：centos7系统，gcc(版本>=7), openmpi(4.8.5，别的没试)，qe(7.0)- gcc安装：

yum -y install centos-release-scl
yum -y install devtoolset-11
source /opt/rh/devtoolset-11/enable #临时使用即可，防止影响其它软件编译，其他版本同理
gcc -v # 确认下编译器版本是否正确

复制代码

- openmpi安装命令：

wget https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v4.1/openmpi-4.1.5.tar.gz
tar -zxvf openmpi-4.1.5.tar.gz
cd openmpi-4.1.5/
yum install -y glibc-headers gcc-c++
./configure --prefix=/path/to/openmpi-4.1.5 # 注意替换你自己你的路径
make all install
echo "# openmpi" >> $HOME/.bashrc
echo "export OPENMPI_PATH=/path/to/openmpi-4.1.5" >> $HOME/.bashrc # 注意替换你自己你的路径
source $HOME/.bashrc
echo "export PATH=\$PATH:\$OPENMPI_PATH/bin" >> $HOME/.bashrc
echo "export LD_LIBRARY_PATH=\$LD_LIBRARY_PATH:\$OPENMPI_PATH/lib" >> $HOME/.bashrc
source $HOME/.bashrc

复制代码

- 构建临时环境（用处似乎不大，作为补充手段就行）：这一步主要是因为编译QE的时候总是使用miniconda的gnu，一直报错，目前还不清楚具体原因，可能是因为conda搭建的虚拟环境优先使用conda的环境，所以想把这个环境暂时删掉，另外配合./configure指定编译器路径，双管齐下，就不信你qe还找不到mpif90的路径

。
使用了笨但容易理解的办法，echo $PATH或者echo $LD_LIBRARY_PATH，所有注册的路径用冒号(:)分隔开了
把输出的路径复制下，删除掉不需要或有冲突的环境
export PATH=删除后的环境路径
LD_LIBRARY_PATH同理

- QE预编译(root不需要加sudo)：
重点1：预编译结束后，请一定检查make.inc的这三个字段，是否是你想用的编译器
MPIF90       = mpif90
F90          = gfortran
CC          = cc
重点2：如果你想更换编译器，请在预编译时指定编译器路径，格式同上，一定要把变量放./configure前面，不然变量不生效
我的预编译命令长这样，仅供参考，注意替换mpi路径：

sudo MPIF90=/path/to/openmpi/bin/mpif90 F90=gfortran CC=cc ./configure -enable-openmp

复制代码

- 编译QE模块(root不需要加sudo)：
这一步出问题的话，基本都是预编译的配置的锅，命令如下：

sudo make all -j

复制代码

最后一个建议，计算的时候指定输入文件最好使用-i选项，不要使用<，有的系统会出问题，计算命令如下：

mpirun -np 4 -x OMP_NUM_THREADS=1 pw.x -i pwscf.in | tee pwscf.out

复制代码

参考：
1. https://www.quantum-espresso.org/Doc/user_guide/node11.html
2. http://bbs.keinsci.com/thread-18600-1-1.html

Liangyusheng · 发表于 Post on 2023-10-30 22:00:00

tanyazhi 发表于 2020-10-31 14:39
1、按照社长的教程，目前已经成功安装qe6.5，后期准备再试一下qe6.6，root账户和普通账户都可以安装成功 ...

朋友，非常感谢你这篇帖子，我就是编译出来之后一直bin目录下没有可执行文件，就是-j并行编译的问题，现在已经全部编译出来了，非常感谢

小白一个 · 发表于 Post on 2024-5-30 16:43:40

社长大人，求救！
我先安装了vasp，按照您的vasp5.4.4极简安装方法装的，（https://www.bilibili.com/video/B ... arch-card.all.click）
现在我想装QE，但在第二步安装OpenMPI时，原来的Intel MPI不知道该怎样注释掉，因为~/.bashrc里面只有source /opt/intel/parallel_studio_xe_2019/psxevars.sh
没有单独可以注释掉MPI的地方，请问该怎样注释掉原来的Intel MPI呢？

sobereva · 发表于 Post on 2024-5-30 16:52:47

小白一个发表于 2024-5-30 16:43
社长大人，求救！
我先安装了vasp，按照您的vasp5.4.4极简安装方法装的，（https://www.bilibili.com/vide ...

把.sh脚本文件读明白了自然就知道了

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[Quantum ESPRESSO] Quantum ESPRESSO在Linux下的安装方法

浏览过的版块