高斯固定二面角优化求助

chasejabble · 发表于 Post on 2015-10-16 09:40:44

高斯优化结构时，想事先固定好几个二面角，然后再优化，请问怎么用GAUSSVIEW固定二面角，可否给说一下详细步骤？

chasejabble · 发表于 Post on 2015-10-16 10:04:32

已学会，谢谢大家

小书童 · 发表于 Post on 2015-10-17 19:15:39

chasejabble 发表于 2015-10-16 10:04
已学会，谢谢大家

楼主学会了，分享一下吧，让我等长长知识

sobereva · 发表于 Post on 2015-10-17 23:22:57

小书童发表于 2015-10-17 19:15
楼主学会了，分享一下吧，让我等长长知识

小书童 · 发表于 Post on 2015-10-18 08:47:59

sobereva 发表于 2015-10-17 23:22

谢谢SOb老师，这个冻结优化可以减少计算量，但是这样优化的结构可靠吗？

sobereva · 发表于 Post on 2015-10-18 17:12:13

小书童发表于 2015-10-18 08:47
谢谢SOb老师，这个冻结优化可以减少计算量，但是这样优化的结构可靠吗？

根本减少不了计算量

小书童 · 发表于 Post on 2015-10-18 19:50:28

sobereva 发表于 2015-10-18 17:12
根本减少不了计算量

那强制固定某些原子的意义是什么呢？这样做的结果可靠吗？

sobereva · 发表于 Post on 2015-10-18 19:51:40

小书童发表于 2015-10-18 19:50
那强制固定某些原子的意义是什么呢？这样做的结果可靠吗？

所以啊，如果不明白为什么这样做，就不要这样做。千万别盲目模仿。

小书童 · 发表于 Post on 2015-10-18 20:39:51

sobereva 发表于 2015-10-18 19:51
所以啊，如果不明白为什么这样做，就不要这样做。千万别盲目模仿。

老师，我的意思是这样做的目的是什么呢？

sobereva · 发表于 Post on 2015-10-18 21:44:40

小书童发表于 2015-10-18 20:39
老师，我的意思是这样做的目的是什么呢？

看研究者的目的啊。
比如柔性扫描某个变量（比如考察基团扭转势垒），实际上每个扫描步，就是固定那个变量不动，而让其它的原子优化
再比如X光衍射实验测到了晶体结构，重原子位置都是准确的，但是氢原子位置无法通过这种实验准确测定，这个时候就可以固定重原子而只优化氢原子位置。

小书童 · 发表于 Post on 2015-10-18 22:00:38

sobereva 发表于 2015-10-18 21:44
看研究者的目的啊。
比如柔性扫描某个变量（比如考察基团扭转势垒），实际上每个扫描步，就是固定那个变 ...

哦哦，原来这样，谢谢老师。但是您说的这个用途是扫描，我理解。但是楼主提问的是结构优化，我的质疑也是固定了某些原子优化，会不会导致结果不对？

sobereva · 发表于 Post on 2015-10-18 22:54:12

小书童发表于 2015-10-18 22:00
哦哦，原来这样，谢谢老师。但是您说的这个用途是扫描，我理解。但是楼主提问的是结构优化，我的质疑也是 ...

还是那句话：关键是你固定它是想做什么。
什么算是对的，什么算是不对的，也要看你的目的。
你不知道该不该固定就不要固定，对于你的研究你觉得有必要固定再固定，但是否固定得有意义要看你化学直觉，毫无意义地瞎固定一定会被审稿人批。
我没法解释更多了。

小书童 · 发表于 Post on 2015-10-19 19:26:46

sobereva 发表于 2015-10-18 22:54
还是那句话：关键是你固定它是想做什么。
什么算是对的，什么算是不对的，也要看你的目的。
你不知道 ...

恩恩，谢谢sob老师的教导！

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