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[Gaussian/gview] 因为停电还有死机,高斯终止。

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学校停电,加上电脑犯抽风,做一个scan运算,中途停止了。点击CHK文件就出现错误restart之后也是从头开始,不能继续。。。2个月心血白费了,十分痛苦。。。想问问还有没有补救措施。
#p opt=modredundant b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity EmpiricalDispersion=GD3



restart的时候用的#p opt=(restart,modredundant) b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity EmpiricalDispersion=GD3

5420C976-7F5E-4E28-96BC-EF71EA006ED3.png (290.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 53)

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发表于 Post on 2015-10-28 12:33:52 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 978142355 于 2015-10-28 12:41 编辑

可以的,试一试(我自己做的刚性扫描)。你的命令可以改为#p opt=(restart,modredundant) b3lyp/6-31g(d) geom=allcheck guess=read EmpiricalDispersion=GD3,试一试。我需要强调的是第二张照片,除了那两行命令外,其余什么也不要加,它的意思就是要读取chk。如果你的chk没了的话,sorry,重做吧。具体见 总结见http://www.gaussian.com/g_blog/faq2.htm



4.jpg (96.73 KB, 下载次数 Times of downloads: 57)

按照第二张片子,从step3开始计算

按照第二张片子,从step3开始计算

1.jpg (33.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 69)

开始文件

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2.jpg (10.39 KB, 下载次数 Times of downloads: 89)

中途计算人为停止,然后再建立一个输入文件

中途计算人为停止,然后再建立一个输入文件

3.jpg (79.02 KB, 下载次数 Times of downloads: 62)

中途人为停止停在了step3

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发表于 Post on 2015-10-28 12:44:01 | 只看该作者 Only view this author
我不知道怎么回事,明明是按照1,2,3,4的顺序整的,发布的时候怎么变成这样了,你按照1,2,3,4的顺序看。sob老师,明明按照次序编排的,怎么发布变顺序了?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-28 12:58:04 | 只看该作者 Only view this author
978142355 发表于 2015-10-28 12:33
可以的,试一试(我自己做的刚性扫描)。你的命令可以改为#p opt=(restart,modredundant) b3lyp/6-31g(d ...

谢谢您的答案,
我想再请问一下,比如我要scan一百个结构,在64时停止了,按照你的方法继续的话,log文件里还会保留之前算好的64个结构吗?
怎么办才能知道restart是否成功呢?
十分感谢

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发表于 Post on 2015-10-28 13:51:23 | 只看该作者 Only view this author
一只耳 发表于 2015-10-28 12:58
谢谢您的答案,
我想再请问一下,比如我要scan一百个结构,在64时停止了,按照你的方法继续的话,log文 ...

实在不行也可以看看log里面最后一个成功的scan到parameter的第几个值了,写一个新的输入,哪些值没算算哪些。

以及scan和opt=modredundant我还是倾向于写个脚本,比如有50个待扫描结构,就写个脚本让它生成50个输入文件。这样至少并行效率100%,而且restart很容易。╮(╯▽╰)╭

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发表于 Post on 2015-10-28 18:00:24 | 只看该作者 Only view this author
978142355 发表于 2015-10-28 12:44
我不知道怎么回事,明明是按照1,2,3,4的顺序整的,发布的时候怎么变成这样了,你按照1,2,3,4的顺序看。sob ...

发图时候最好不要选择上传附件,而是应该选择上传图片,传上去之后,点击图片名字把图插入到帖子相应位置,就不会有你说的问题。置顶的新人必读介绍了操作。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2015-10-28 18:57:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-28 18:00
发图时候最好不要选择上传附件,而是应该选择上传图片,传上去之后,点击图片名字把图插入到帖子相应位置 ...

哦,这样啊,以前读过,第一回发给忘了。。。。。。以后注意。
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发表于 Post on 2015-10-28 19:04:25 | 只看该作者 Only view this author
一只耳 发表于 2015-10-28 12:58
谢谢您的答案,
我想再请问一下,比如我要scan一百个结构,在64时停止了,按照你的方法继续的话,log文 ...

这个是不会保留的,因为是接着从第64歩开始的。我有个想法。你把前64歩的复制粘贴到新算的log文件中,或者把两次的能量数据copy出来,做个图。感觉应该会有更好的方法,我也学习学习。或者按照5楼Li老师的说法弄一弄也好。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-29 09:58:50 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-10-28 13:51
实在不行也可以看看log里面最后一个成功的scan到parameter的第几个值了,写一个新的输入,哪些值没算算哪 ...

谢谢您的答案。
编脚本白痴一个,完全不会。。。。
还是接着算吧。

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发表于 Post on 2015-10-31 08:47:55 | 只看该作者 Only view this author
978142355 发表于 2015-10-28 12:33
可以的,试一试(我自己做的刚性扫描)。你的命令可以改为#p opt=(restart,modredundant) b3lyp/6-31g(d ...

为何您的chk文件可以放在桌面呢?
真诚相待,淡淡相处,方天久地长^^

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发表于 Post on 2015-10-31 12:38:48 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 978142355 于 2015-10-31 12:40 编辑
hcxytpp@163.com 发表于 2015-10-31 08:47
为何您的chk文件可以放在桌面呢?

windows 7系统以后都可以放在桌面上的,以前的windows XP肯定是不行。但是windows 7系统虽然可以放桌面,前提其路径上别有中文字符。
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