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[超级计算机] 求助按照sob大神编译好的vasp,测试没问题,跑起来自己的5步就直接显示内存...

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本帖最后由 ZizhenZhou 于 2020-11-2 05:03 编辑

抱歉抱歉,重新编辑了一下。
如题, 编译的vasp5.4.4.
测试什么的都没问题, 跑起来自己的直接显示内存不足。 用的超算3个节点,每个20核。
以前从来没有遇到过这样的情况。
提交脚本如下:

#!/bin/bash
#SBATCH  --job-name="SrTiO3_6"
#SBATCH -p Mem128s
#SBATCH --mem=129000
#SBATCH -N 3
# If you only need a few cores disable this and instead use
#SBATCH --exclusive
#SBATCH -n 60
# SBATCH --ntasks-per-node=20
# How long will it run [[HH:]MM:]SS, use UNLIMITED for no
#SBATCH --time=UNLIMITED

echo "Working directory is:"
pwd
source /etc/profile

# Loads Gaussian application directory
export GAUSS_JOBID=$SLURM_JOB_ID
export GAUSS_USER=$SLURM_SUBMIT_DIR
export TSNET_PATH=$GAUSS_LEXEDIR
export g09error=""
export OMP_NUM_THREADS=1
echo -n "Master Process is on: "
hostname

echo -n "Machine details are: "
uname -a
echo "Local Working Directory: $TMPDIR"

# Main Program Run
date
time mpirun  -n 60  /home/z5189670/vaspmake/vasp.5.4.4/bin/
date

echo "Finished job $GAUSS_JOBID"
~                                       

更新一下, 根据 ’http://bbs.keinsci.com/thread-16082-1-1.html
重新编译并添加soft-hpc之后正常运行。

但是遇到了第二天提交相同任务时候又一次报出内存超出。再一次安装soft-hpc之后解决,不清楚具体原因,想请问各位看法。

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发表于 Post on 2020-10-31 12:27:21 | 只看该作者 Only view this author
这又不是画画。。。能先把颜色去掉么
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2020-10-31 17:58:11 | 只看该作者 Only view this author
发帖之后都自己不看么?这么五颜六色看着不累么?重新编辑帖子,便于他人阅读。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-2 05:03:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-10-31 17:58
发帖之后都自己不看么?这么五颜六色看着不累么?重新编辑帖子,便于他人阅读。

抱歉抱歉,已经重新编辑

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-2 05:08:40 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-10-31 12:27
这又不是画画。。。能先把颜色去掉么

已重新编辑,真抱歉

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