过渡态虚频100多，振动方向不对，该怎么调整结构

wzkchem5

嘤嘤嘤 发表于 2021-6-25 16:38
请问什么是插入的image？

用NEB方法找过渡态的时候，需要准备若干个结构，这些结构从反应物逐渐过渡到产物，而不能只准备一个过渡态的初猜。所谓插入的image就是指的这若干个结构。
只有NEB以及一些类似NEB的方法有image的概念，其他的一些找过渡态的方法，比如单点法(opt=TS)、dimer法、QST2、QST3都没有image的概念。

wzkchem5

嘤嘤嘤 发表于 2021-6-25 16:39
请问直接对TS进行IRC看看反应两端是不是有一端是反应物不就可以知道你这个是不是对的TS了不就行了嘛？为什 ...

因为跑IRC比较慢。如果IRC跑出来发现是对的，那么皆大欢喜，但是如果IRC跑出来发现是错的，那就多费了一次跑IRC的时间，所以预计过渡态找错了的概率很大的时候，有可能不经IRC确认，直接重新找过渡态更好。如果重新找到的过渡态和这次找出来的完全一样，再考虑过渡态其实找对了的可能性，并且跑IRC确认。

科研菜菜

嘤嘤嘤 发表于 2021-6-25 23:39
请问直接对TS进行IRC看看反应两端是不是有一端是反应物不就可以知道你这个是不是对的TS了不就行了嘛？为什 ...

我所看到的TS确认方法是振动只存在一个虚频，可能有的情况是搜到了TS附近的构型，但并不是最终的，所以要进行虚频振动分析

嘤嘤嘤

wzkchem5 发表于 2021-6-26 01:25
因为跑IRC比较慢。如果IRC跑出来发现是对的，那么皆大欢喜，但是如果IRC跑出来发现是错的，那就多费了一 ...

嗯嗯，知道了，谢谢老师

wzkchem5

科研菜菜 发表于 2021-6-26 08:00
我所看到的TS确认方法是振动只存在一个虚频，可能有的情况是搜到了TS附近的构型，但并不是最终的，所以要 ...

有且仅有一个虚频只能证明这是一个过渡态，不能证明这是连接你所研究的那个反应物和产物的过渡态。
证明这个过渡态确实是连接着你所要的反应物和产物的方法：
方法一：看虚频振动方向（较不严格）
方法二：一开始找过渡态就用NEB等基于反应路径的方法找（相对严格一些，但要求image数足够多）
方法三：把过渡态结构稍微扰动一下，做结构优化，看能否到达反应物和产物（更严格一些）
方法四：跑IRC（最严格，但也最慢）

张家铭

嘤嘤嘤 发表于 2021-6-25 23:39
请问直接对TS进行IRC看看反应两端是不是有一端是反应物不就可以知道你这个是不是对的TS了不就行了嘛？为什 ...

对，做IRC证明一下。而不是只看看虚频。