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[GROMACS] 求助opls力场可以用其他形式的improper dihedral吗

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文献里的形式是这样的
和opls的improper dihedral形式不同,要怎么设置呢

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发表于 Post on 2020-11-6 18:13:36 | 只看该作者 Only view this author
improper和dihedral是两码事,这个文献没写对

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发表于 Post on 2020-11-7 17:13:14 | 只看该作者 Only view this author
improper是improper,dihedral是dihedral,分清楚
当前图里的是improper形式,而该有的dihedral却没写。你去找个正经点的关于力场的文章看
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-9 17:35:36 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 baima 于 2020-11-10 09:12 编辑
fhh2626 发表于 2020-11-6 18:13
improper和dihedral是两码事,这个文献没写对

老师您好,我还想问一下二维材料对二面角的定义会有什么不一样吗,我做的是六方氮化硼,这是上面公式里对improper的定义,ijk和jkl的夹角,好像和我查到的improper定义不太一样,一般指的应该是jik和ikl的角吧?

然后另一篇文献里,定义的dihedral也和一般形式不一样





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发表于 Post on 2020-11-9 19:13:54 | 只看该作者 Only view this author
baima 发表于 2020-11-9 17:35
老师您好,我还想问一下二维材料对二面角的定义会有什么不一样吗,我做的是六方氮化硼,这是上面公式里对 ...

贴图方式不对,其他人看不到。重新编辑帖子并仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么正确贴图,此问题在这里还特意强调了:http://bbs.keinsci.com/thread-18961-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-10 09:13:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-9 19:13
贴图方式不对,其他人看不到。重新编辑帖子并仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么正确贴图,此问题在这里还 ...

谢谢sob老师提醒,已改正

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发表于 Post on 2020-11-11 00:39:10 | 只看该作者 Only view this author
baima 发表于 2020-11-9 17:35
老师您好,我还想问一下二维材料对二面角的定义会有什么不一样吗,我做的是六方氮化硼,这是上面公式里对 ...

improper具体用哪个角没有统一的定义,还有的文章用偏离平面的垂直距离做为自变量。只要improper函数能起到满足平面性的效果就行了
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