计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 9214|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 蛋白质的pdb结构文件中phi,psi二面角大小如何得出?

[复制链接 Copy URL]

15

帖子

0

威望

139

eV
积分
154

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
现有所需研究蛋白质的pdb结构文件,如果想知道此晶体结构的每个氨基酸的phi,psi二面角大小,请问是否有办法可以得到?希望大家不吝赐教!

222

帖子

5

威望

2589

eV
积分
2911

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2020-11-9 22:57:01 | 只看该作者 Only view this author
gmx chi

15

帖子

0

威望

139

eV
积分
154

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-10 10:51:33 | 只看该作者 Only view this author

有查看到这个命令,不知道可否以gmx chi算出的第一帧作为我pdb的原始二面角信息

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-22 03:15 , Processed in 0.149265 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list