描述分子间相互作用的能量图怎么得到？

zj123_45 · 发表于 Post on 2020-12-3 22:31:22

请问一下这种描述分子间相互作用的能量图可以用什么作呢，multiwfn可以吗，谢谢

sobereva · 发表于 Post on 2020-12-4 02:09:44

Multiwfn是做这类事最强大而且是最流行的程序，仔细看

通过独立梯度模型(IGM)考察分子间弱相互作用
http://sobereva.com/407（http://bbs.keinsci.com/thread-9472-1-1.html）
使用Multiwfn图形化研究弱相互作用
http://sobereva.com/68
使用Multiwfn做NCI分析展现分子内和分子间弱相互作用
https://www.bilibili.com/video/av71561024
用Multiwfn+VMD做RDG分析时的一些要点和常见问题
http://sobereva.com/291（http://bbs.keinsci.com/thread-1206-1-1.html）

用Multiwfn+VMD做这类图的已发表的文章差不多都已经得有2000篇左右了

zj123_45 · 发表于 Post on 2020-12-4 10:14:07

sobereva 发表于 2020-12-4 02:09
Multiwfn是做这类事最强大而且是最流行的程序，仔细看

通过独立梯度模型(IGM)考察分子间弱相互作用

好的，我仔细看看，谢谢sob老师！

lijiayisjtu · 发表于 Post on 2020-12-12 20:21:31

这涉及相互作用能量的计算，可以用Gaussian 加conterpoise=2 这样的关键词，得到数值。
相互作用的可视化，这图应该是用了RDG方法

zj123_45 · 发表于 Post on 2020-12-13 21:14:22

lijiayisjtu 发表于 2020-12-12 20:21
这涉及相互作用能量的计算，可以用Gaussian 加conterpoise=2 这样的关键词，得到数值。
相互作用的可视化 ...

好的，谢谢！

xxzj · 发表于 Post on 2021-12-16 09:32:44

sobereva 发表于 2020-12-4 02:09
Multiwfn是做这类事最强大而且是最流行的程序，仔细看

通过独立梯度模型(IGM)考察分子间弱相互作用

老师，分子间π-π相互作用距离一般为3.5作用，如何高于5.0还可以认为存在π-π作用吗？

sobereva · 发表于 Post on 2021-12-16 14:41:47

xxzj 发表于 2021-12-16 09:32
老师，分子间π-π相互作用距离一般为3.5作用，如何高于5.0还可以认为存在π-π作用吗？

病句
不能认为

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[波函数分析求助] 描述分子间相互作用的能量图怎么得到？