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[GROMACS] 求助:如何添加角限制使分子轴始终与Z轴平行

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楼主
对于两个一个分子,我想使他的轴始终与Z轴平行。我想要指定两个任意的原子i,j;通过角限制使两个原子之间的向量与z轴平行

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发表于 Post on 2020-12-9 02:58:05 | 只看该作者 Only view this author
在[moleculetype]里加上比如
[ angle_restraints_z ]
10 11 1 0.0 300.0 1
说明令10-11原子平行与Z轴(维持夹角为0),限制势强度为300 kJ/mol
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-9 09:04:40 | 只看该作者 Only view this author
多谢sob老师!!

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