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[VMD] 求助 VMD改变原子半径大小

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  请问大家 VMD 修改原子大小除了Graphics-->Representations这种调节方法外,还有没有其他的方法直接调节原子半径大小呢?

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发表于 Post on 2020-12-30 08:48:41 | 只看该作者 Only view this author
你想怎么改?这还不够方便?其它方式就是通过VMD的命令行语句了,还不如在界面上改方便直观,除非你要改默认设置、批处理
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-12-30 15:42:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-12-30 08:48
你想怎么改?这还不够方便?其它方式就是通过VMD的命令行语句了,还不如在界面上改方便直观,除非你要改默 ...

这样改的话键的半径和原子半径有的不一样大小 我想调到相同半径。请问命令行怎么修改原子半径呢?

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发表于 Post on 2021-1-2 00:13:34 | 只看该作者 Only view this author
小谁~ 发表于 2020-12-30 15:42
这样改的话键的半径和原子半径有的不一样大小 我想调到相同半径。请问命令行怎么修改原子半径呢?

语义不明
CPK模式的键的粗细和原子球的大小是分别可调的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-9-29 16:33:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-1-2 00:13
语义不明
CPK模式的键的粗细和原子球的大小是分别可调的

请问通过VMD的命令行语句来调整CPK模式的原子大小,相关的命令行语句是什么呢?vmd手册里面好像也没写这个

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发表于 Post on 2022-9-29 16:43:43 | 只看该作者 Only view this author
calcifa 发表于 2022-9-29 16:33
请问通过VMD的命令行语句来调整CPK模式的原子大小,相关的命令行语句是什么呢?vmd手册里面好像也没写这 ...

打开 Extensions - Tk Console
开启 File - log Tcl Commands to Console
然后调一下半径,相关的语句就在 console 里显示出来了

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发表于 Post on 2022-9-29 16:50:23 | 只看该作者 Only view this author
highlight 发表于 2022-9-29 16:43
打开 Extensions - Tk Console
开启 File - log Tcl Commands to Console
然后调一下半径,相关的语句 ...

非常感谢!

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