在Multiwfn使用AdNDP方法分析体系作用

wang1345

我想问一下，用AdNDP方法分析体系中作用的时候，如果为弱相互作用，是不是相互作用的原子间不能做出2e-2e轨道？如果为共价作用是不是就能做出2c-2e的轨道？

文献中的AdNDP轨道是用什么软件做出来的？是Multiwfn软件吗？

这两个图是我自己做出来的AdNDP轨道，我不知道对不对，第一个图中的复合物我分析的为非共价相互作用，做出的2c-2e轨道是这样的；第二个图中的复合物分析的为共价作用，做出的2c-2e轨道是这样的，并且共价作用的体系中1c-1e中没有出现在形成复合物时提供孤对电子的原子，这是为什么？

sobereva

只有共价相互作用之间才会有2c-2e
对于非共价相互作用，两个原子之间如果离得近，AdNDP也能找出2c-2e，但这样的肯定占据数很低，你取它没意义。非共价相互作用不适合AdNDP分析。适合的分析方式这里都讨论了
Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览
http://sobereva.com/252

AdNDP分析一个是产生AdNDP数据，一个是作图。Multiwfn二者都能干，能得到和文献里的一样的结果，当然作图效果、颜色、材质这些会不同。你把AdNDP轨道数据导出成cube文件，之后能用各种各样的工具作图，这就随意了。VMD也完全可以作出同样效果的图，但文中肯定不是VMD作的。