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[波函数分析求助] 香豆素与6-甲基香豆素的弱相互作用分析求助

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本帖最后由 yyllxx 于 2021-1-17 11:11 编辑

我研究的课题是:太赫兹光谱研究物质:香豆素与6-甲基香豆素
本来打算通过“范德华势”+“静电势”一起分析弱相互作用,但遇到些问题。
首先通过能力分解分析(EDA-FF)预判分子间弱相互作用,结果如图一
静电势分析结果如预期,如图二所示
通过能力分解分析结果,选取5-7片段进行范德华势分析
问题一:但发现凡是范德华主导作用的片段都是π-π堆积,所以他们之间到底是范德华作用主导呢还是π-π堆积呢?看到卢天老师在色散校正博文中说到的一句话“一般说的范德华作用以及π-π堆积作用的本质都是色散作用”,所以我该如何建立π-π堆积作用与范德华势之间的关系呢?
问题二:在进行范德华势分析时,两个片段绘制等值面,蓝绿色是用来区别两个片段的,并不是用来区别正负值的,这样的范德华势分析有什么用呢?如图三所示,并没有表现出范德华作用呀
问题三:6-甲基香豆素单分子的范德华势中有正负值,但是香豆素单分子中只有正或负一种情况,能量分解分析中色散作用和交换互斥都有占比呀,为什么没体现出来呢?
希望各位老师同学帮我解答,十分感谢。

QQ图片20210102213601.png (237.77 KB, 下载次数 Times of downloads: 40)

图二 静电势分析结果

图二  静电势分析结果

M3{)KXGUI4LDQWQ%[N1GPOL.png (18.94 KB, 下载次数 Times of downloads: 44)

图一 能量分解分析结果

图一  能量分解分析结果

%UEBCG[6KR3~5UCP4~09T1J.png (65.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 50)

图三 两个片段范德华势分析

图三 两个片段范德华势分析

V(OK4)H]628GKL_8_`O6`(6.png (61.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 45)

图四 单分子范德华势分析

图四 单分子范德华势分析

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发表于 Post on 2021-1-17 05:37:57 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“弱相互作用分析”改了,以后务必注意

贴图的时候把图片按顺序插入,不要让图片以无序方式出现在帖子里,注意看置顶的新社员必读贴里关于贴图的说明。每个图片对应什么含义都说清楚,别让别人去猜
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2021-1-17 05:54:17 | 只看该作者 Only view this author
那叫能量分解不叫能力分解

1 pi-pi的本质就是近乎平行堆叠的pi共轭分子间的范德华作用中的色散吸引部分所致,仔细看此文了解更多相关知识
全面探究18碳环独特的分子间相互作用与pi-pi堆积特征
http://sobereva.com/572http://bbs.keinsci.com/thread-19660-1-1.html

2 先把图片序号标记清楚再说

3 等值面数值(isovalue)的选取严重影响你看到的等值面图像
色散作用不叫什么“色散校正”,完全是两个次元的概念
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-1-17 11:05:31 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 yyllxx 于 2021-1-17 11:13 编辑
sobereva 发表于 2021-1-17 05:37
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反 ...

下次一定注意,谢谢老师!老师,图的顺序不知道咋挪,图一和图二的顺序反了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-1-17 11:15:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-1-17 05:54
那叫能量分解不叫能力分解

1 pi-pi的本质就是近乎平行堆叠的pi共轭分子间的范德华作用中的色散吸引部分 ...

老师,图片标序说明了,色散校正也改为色散作用,为我的治学不严谨感到抱歉
麻烦您再次帮我解答,非常感谢呀!

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发表于 Post on 2021-1-22 14:06:14 | 只看该作者 Only view this author
2 范德华势本来就有正负号,“并不是用来区别正负值的” 这种描述等同于说一个片段的范德华势只有正值,这种描述显然是莫名其妙的。

一个分子浸在另一个分子的范德华势的等值面里,自然就已经说明了必然存在范德华作用。

搞清楚分子力场中分子间范德华作用的表达式,以及范德华势的定义思想,不可能想不明白。
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