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[GROMACS] 薄膜沉积用gromacs和lammps有什么区别吗?

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请问用gromacs实现薄膜沉积和lammps实现,两个有什么区别吗?看了相关文献,很多都是lammps实现,也有用gromacs实现的。
觉得gromacs好上手一些?而且计算比较快,但是gromacs关于沉积的资料比较少。lammps做的比较多,但是计算速度慢,我找到的资料也很少。
我是小白,对lammps有些了解,这几天才知道gromacs的一些性能。请问大家能给我些建议吗?


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发表于 Post on 2021-3-4 16:27:16 | 只看该作者 Only view this author
说清楚体系具体特征,是什么类型物质。但凡适合GROMACS描述的情况一律用GROMACS
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发表于 Post on 2021-3-4 17:23:22 | 只看该作者 Only view this author
可能研究金属表面沉积金属的用lammps的多,如果金属表面沉积有机分子的话也有用gromacs的,需要自己写脚本每间隔一定时间往体系里添加一个分子。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-6 17:10:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-4 16:27
说清楚体系具体特征,是什么类型物质。但凡适合GROMACS描述的情况一律用GROMACS

630不锈钢上溅射沉积二氧化硅或者氧化铝,以及在二氧化硅上溅射沉积合金(镍铬合金和卡玛合金等),想要研究不同的材料以及不同的工艺参数。
请问这两种类型可以在GROMACS上实现吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-6 17:12:42 | 只看该作者 Only view this author
mol 发表于 2021-3-4 17:23
可能研究金属表面沉积金属的用lammps的多,如果金属表面沉积有机分子的话也有用gromacs的,需要自己写脚本 ...

请问沉积后薄膜的一些性质,粗糙度、内应力、密度也可以自己写脚本计算吗?还是导出到其他软件计算呢?
请问要是没有人带,自学的话这个实现起来难吗?

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发表于 Post on 2021-3-6 18:28:30 | 只看该作者 Only view this author
陈曦 发表于 2021-3-6 17:10
630不锈钢上溅射沉积二氧化硅或者氧化铝,以及在二氧化硅上溅射沉积合金(镍铬合金和卡玛合金等),想要 ...

这个材料你看到有用gromacs的吗?应该还是用lammps合适的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-6 20:14:01 | 只看该作者 Only view this author
tjuptz 发表于 2021-3-6 18:28
这个材料你看到有用gromacs的吗?应该还是用lammps合适的

好的,谢谢!有看到二氧化硅沉积到二氧化硅上的,其他的没有看到过。

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发表于 Post on 2021-3-7 05:36:05 | 只看该作者 Only view this author
陈曦 发表于 2021-3-6 17:10
630不锈钢上溅射沉积二氧化硅或者氧化铝,以及在二氧化硅上溅射沉积合金(镍铬合金和卡玛合金等),想要 ...

此类情况不适合GROMACS
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-8 09:59:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-7 05:36
此类情况不适合GROMACS

好的,谢谢老师

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