求助：GMX轨迹处理报错：Floating point exception (core dumped)怎么解决？

一只咸鱼 · 发表于 Post on 2021-3-18 20:46:43

最近实验室购置了一个i9处理器+4*微星2080Ti显卡+64G内存的服务器，在上面跑动力学的时候，运行过程不会报错终止，但是计算RMSD或者处理轨迹就会报错并终止（如图），跳过这报错的几帧轨迹后面的可以继续分析，但是处理几ns后又会遇到这样的问题。系统是Cnetos 7.8 GMX版本是2019.3 GCC版本是默认版本4.8 Cuda版本是9.1
相同的体系相同的参数在另一个服务器（铂金8173M CPU + 技嘉2080TI）就不会出现这几个问题。

换了好几次系统都没解决，一直会出现这个问题。
请问有大佬遇到类似的问题吗，或者有解决方法吗？

sobereva · 发表于 Post on 2021-3-19 06:51:23

换个gmx版本再试，跟硬件没必然关系。也可以把轨迹拷到另一台机子上处理看看什么情况

一只咸鱼 · 发表于 Post on 2021-3-19 10:49:41

sobereva 发表于 2021-3-19 06:51
换个gmx版本再试，跟硬件没必然关系。也可以把轨迹拷到另一台机子上处理看看什么情况

好的，我试一下，谢谢卢老师。

ys_song · 发表于 Post on 2022-3-4 21:39:48

似乎是硬件性能的问题，如果一台电脑有core dumped错误，另一台没有，报错的都是性能差的。

yidayyds · 发表于 Post on 2024-10-26 00:03:38

你好请问问题解决了吗

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