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[GROMACS] 关于固态气态液态真空条件的模拟问题

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楼主
各位老师,我有一个小白问题
1、在计算中,物质的固态,液态等状态是如何表达的?
2、固体物质所处的真空、液态条件又是怎么实现的,分不太清?

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发表于 Post on 2021-4-1 00:24:25 | 只看该作者 Only view this author
1 不需要特殊的表达。真实情况是什么条件,模拟就设什么条件,自然就能得到相应条件下物质的状态。但力场终究有误差,熔点和真实不会正好相同。另外模拟固态用的初始结构一般基于已知的晶体结构。

2 在真空里就设真空区,在溶液中就加上溶剂分子
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-1 09:15:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-4-1 00:24
1 不需要特殊的表达。真实情况是什么条件,模拟就设什么条件,自然就能得到相应条件下物质的状态。但力场终 ...

谢谢老师,真空区可以理解盒子中什么溶剂也没有,只有聚合物,然后进行模拟吗?

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发表于 Post on 2021-4-1 14:27:21 | 只看该作者 Only view this author
努力向上的boy 发表于 2021-4-1 09:15
谢谢老师,真空区可以理解盒子中什么溶剂也没有,只有聚合物,然后进行模拟吗?

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