vasp用DIMER找过渡态，频率得到唯一虚频后，振动方向指向反应物

calamity · 发表于 Post on 2021-4-8 20:33:25

如题，振动模式计算得到虚频（唯一）后，使用jmol可视化振动方向，反向其方向指向反应物而非产物，请问各位老师这样的过渡态是正确的过渡态吗?振动方向指向反应物和指向产物是不是一个意思？

get-it · 发表于 Post on 2021-4-9 16:15:42

振动模式的反方向呢？

喵星大佬 · 发表于 Post on 2021-4-9 19:44:49

都叫振动了那肯定有两个方向啊。。。。至少有一边要指向反应物的

sobereva · 发表于 Post on 2021-4-10 06:05:24

你不用管箭头的方向朝哪边，你只需要看箭头的两侧（方向无所谓）是否一头朝着反应物一头朝着产物方向

calamity · 发表于 Post on 2021-4-12 20:30:41

喵星大佬发表于 2021-4-9 19:44
都叫振动了那肯定有两个方向啊。。。。至少有一边要指向反应物的

好的，我之前陷入误区了以为这个就一个方向

calamity · 发表于 Post on 2021-4-12 20:30:54

sobereva 发表于 2021-4-10 06:05
你不用管箭头的方向朝哪边，你只需要看箭头的两侧（方向无所谓）是否一头朝着反应物一头朝着产物方向

谢谢老师，现在明白了

calamity · 发表于 Post on 2021-4-12 20:31:33

get-it 发表于 2021-4-9 16:15
振动模式的反方向呢？

反方向就是向产物的，现在看来振动本来就有两个方向，所以无所谓正反

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[VASP] vasp用DIMER找过渡态，频率得到唯一虚频后，振动方向指向反应物