请问怎样将脚本文件提交给超算（LSF）

zhi2679889405 · 发表于 Post on 2021-4-12 17:30:38

利用此脚本提交作业

#BSUB -q normal

#BSUB -n 40

#BSUB -R "span[ptile=20]"

#BSUB -cwd .

#BSUB -e %J.err

#BSUB -o %J.out

export g09root=/opt/

source $g09root/g09/bsd/g09.profile

export PATH=$g09root/g09:$PATH

export GAUSS_SCRDIR=/tmp

export GAUSS_LFLAGS="-opt 'Tsnet.Node.lindarsharg:ssh'"

#list host name

export GAUSS_WDEF="$(cat $LSB_DJOB_HOSTFILE|sort|uniq|awk '{ printf("%s,",$1) }' | sed 's/,$//')"

#specify SMP core number

export GAUSS_PDEF="20"

g09 < Au20tcnq-edge.com > Au20tcnq-edge.log

#BSUB -q default 队列

#BSUB -n 40 : 总核数

#BSUB -R "span[ptile=20]" : 每个节点核数

#BSUB -e %J.err : 标准错误流重定向文件，%J表示作业号

#BSUB -o %J.out : 标准输出重定向文件，%J表示作业号

export GAUSS_PDEF="20" : 每个节点核数，需span的值一致

Au20tcnq-edge.com : 高斯输入文件，只需要制定%check %mem, 不需要指定nprocs等

作业提交方式：

bsub < g90.sh

请问该如何操作呢，第一次使用，麻烦大家了

abin · 发表于 Post on 2021-4-12 21:20:23

文字描述部分，最后几行，仔细读呀……

zhi2679889405 · 发表于 Post on 2021-4-12 21:55:20

abin 发表于 2021-4-12 21:20
文字描述部分，最后几行，仔细读呀……

请问是不是需要先将脚本创建好后命名为g90.sh ,再提交这个作业，Au20tcnq-edge.com是不是需要改成自己想要输入文件的名字

abin · 发表于 Post on 2021-4-13 08:07:37

就是字面意思呀。
这玩意有啥难以理解的。

按照字面描述试试呀

zhi2679889405 · 发表于 Post on 2021-4-13 21:41:07

abin 发表于 2021-4-13 08:07
就是字面意思呀。
这玩意有啥难以理解的。

以前没学习过Linux，学习了一些命令后，才把任务提交上去，麻烦前辈了

abin · 发表于 Post on 2021-4-13 21:46:45

zhi2679889405 发表于 2021-4-13 21:41
以前没学习过Linux，学习了一些命令后，才把任务提交上去，麻烦前辈了

要么你去B站，搜索我的视频看看。
我记得有几个是告诉微软用户怎么使用Linux机器的。

无非就那么几个指令，
cp mv head top bash & ps kill sed grep chmod
几乎用不到其他的。

zhi2679889405 · 发表于 Post on 2021-4-14 08:58:03

abin 发表于 2021-4-13 21:46
要么你去B站，搜索我的视频看看。
我记得有几个是告诉微软用户怎么使用Linux机器的。

好的，谢谢啦

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